More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3297 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 		 333 aa  655    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  83.48 
 
 		 333 aa  552  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  83.48 
 
 		 333 aa  552  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  83.18 
 
 		 333 aa  551  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  83.48 
 
 		 333 aa  552  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  83.48 
 
 		 333 aa  551  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  83.48 
 
 		 333 aa  552  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  83.48 
 
 		 333 aa  552  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  83.48 
 
 		 333 aa  551  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  83.48 
 
 		 333 aa  552  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  82.88 
 
 		 333 aa  549  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  82.28 
 
 		 333 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  82.58 
 
 		 333 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.09 
 
 		 348 aa  322  7e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  53.24 
 
 		 349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.43 
 
 		 349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  51.47 
 
 		 322 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  49.84 
 
 		 353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  49.22 
 
 		 353 aa  301  1e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  48.91 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.17 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.88 
 
 		 343 aa  299  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  49.23 
 
 		 341 aa  298  7e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  49.52 
 
 		 329 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  48.77 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  50.65 
 
 		 338 aa  293  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  46.86 
 
 		 348 aa  292  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.35 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.86 
 
 		 337 aa  289  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.66 
 
 		 331 aa  288  7e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  51.34 
 
 		 328 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  47.19 
 
 		 349 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  46.56 
 
 		 349 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.82 
 
 		 344 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.52 
 
 		 329 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1012  NADH dehydrogenase subunit H  49.68 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1207  NADH dehydrogenase subunit H  49.68 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1078  NADH dehydrogenase subunit H  49.68 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.425523 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  49.83 
 
 		 341 aa  282  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  49.2 
 
 		 340 aa  281  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  48.87 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  48.32 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  48.22 
 
 		 329 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.88 
 
 		 331 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  44.51 
 
 		 349 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.01 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.92 
 
 		 366 aa  279  5e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  47.15 
 
 		 340 aa  279  6e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  47.15 
 
 		 340 aa  279  6e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  45.48 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2052  NADH dehydrogenase subunit H  48.42 
 
 		 340 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  48.18 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  45.68 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  48.18 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4133  NADH dehydrogenase subunit H  48.54 
 
 		 340 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  50.32 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1869  NADH dehydrogenase (quinone)  43.3 
 
 		 372 aa  276  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.01 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  49.82 
 
 		 351 aa  276  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4397  NADH dehydrogenase subunit H  48.54 
 
 		 340 aa  276  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  44.94 
 
 		 372 aa  275  6e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  44.44 
 
 		 372 aa  275  6e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2766  NADH dehydrogenase subunit H  43.17 
 
 		 324 aa  275  8e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1498  NADH dehydrogenase subunit H  43.3 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  50.18 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  43.6 
 
 		 416 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  43.6 
 
 		 416 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  43.6 
 
 		 416 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  45.48 
 
 		 325 aa  272  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  43.44 
 
 		 322 aa  271  9e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0638  NADH dehydrogenase I chain H  45.37 
 
 		 372 aa  271  9e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  44.69 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  45.18 
 
 		 349 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0846  NADH dehydrogenase (quinone)  45.37 
 
 		 368 aa  271  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.637242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  45.74 
 
 		 462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3219  NADH dehydrogenase subunit H  46.15 
 
 		 337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  45.48 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  43.73 
 
 		 410 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  45.48 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  45.48 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  45.48 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  45.48 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  44.31 
 
 		 411 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0897  NADH dehydrogenase subunit H  46.2 
 
 		 347 aa  269  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0965  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.37 
 
 		 372 aa  269  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00465289  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1721  NADH dehydrogenase subunit H  46.06 
 
 		 347 aa  269  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.01 
 
 		 349 aa  268  8e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  48.67 
 
 		 355 aa  268  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.48 
 
 		 339 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  48.67 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  45.65 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1360  NADH dehydrogenase subunit H  45.95 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0549439  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  44.82 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.68 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  47.42 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  47.27 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  47.27 
 
 		 352 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  47.27 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  44.82 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  45.98 
 
 		 449 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>