More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0203 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  100 
 
 
329 aa  650    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  52.13 
 
 
348 aa  361  8e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.53 
 
 
349 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  51.6 
 
 
353 aa  328  7e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  50.62 
 
 
353 aa  328  8e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  51.6 
 
 
353 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.73 
 
 
349 aa  325  6e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1597  NADH dehydrogenase (quinone)  55.7 
 
 
324 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  53.45 
 
 
333 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  45.91 
 
 
348 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0747  NADH dehydrogenase (quinone)  47.58 
 
 
342 aa  296  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.97 
 
 
337 aa  296  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  48.46 
 
 
333 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  48.87 
 
 
329 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  42.22 
 
 
349 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  49.15 
 
 
333 aa  288  7e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  41.92 
 
 
349 aa  288  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  44.25 
 
 
413 aa  287  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  48.81 
 
 
333 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  48.81 
 
 
333 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  49.15 
 
 
333 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  47.24 
 
 
333 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  46.94 
 
 
351 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  48.81 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  48.81 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  48.81 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  48.81 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  48.81 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  48.81 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  45.71 
 
 
449 aa  286  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  46 
 
 
322 aa  285  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  46.04 
 
 
441 aa  282  6.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.7 
 
 
329 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  42.11 
 
 
349 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  42.31 
 
 
440 aa  282  7.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.58 
 
 
331 aa  281  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  45.82 
 
 
447 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  45.69 
 
 
341 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 
433 aa  280  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  45.29 
 
 
451 aa  278  8e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  44.16 
 
 
317 aa  277  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  43.95 
 
 
416 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  43.95 
 
 
416 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  43.95 
 
 
416 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  45.21 
 
 
330 aa  276  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  47.85 
 
 
329 aa  276  5e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  46.77 
 
 
340 aa  275  9e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.24 
 
 
337 aa  275  9e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  42.2 
 
 
372 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  42.2 
 
 
372 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  43.54 
 
 
410 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  42.2 
 
 
384 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  41.87 
 
 
367 aa  273  3e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  42.82 
 
 
411 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  46.45 
 
 
340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  42.17 
 
 
384 aa  271  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  46.36 
 
 
341 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  42.2 
 
 
372 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  44.48 
 
 
430 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  46.36 
 
 
341 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  47.06 
 
 
340 aa  270  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  47.06 
 
 
340 aa  270  2e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.03 
 
 
343 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3819  NADH dehydrogenase (quinone)  46.93 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  41.57 
 
 
369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  44.34 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  43.71 
 
 
486 aa  270  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  45.81 
 
 
372 aa  269  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  44.04 
 
 
330 aa  269  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  41.28 
 
 
372 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  45.59 
 
 
372 aa  268  8e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  42.77 
 
 
372 aa  268  8e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  43.81 
 
 
438 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0846  NADH dehydrogenase (quinone)  45.72 
 
 
368 aa  267  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.637242  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  40.06 
 
 
364 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0749  NADH dehydrogenase (quinone)  42.95 
 
 
337 aa  266  4e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0374707  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  43.09 
 
 
372 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  42.47 
 
 
345 aa  266  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.31 
 
 
339 aa  265  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  43.09 
 
 
372 aa  265  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  41.61 
 
 
372 aa  265  8e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.37 
 
 
344 aa  264  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  43.09 
 
 
372 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  43.57 
 
 
358 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1353  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.24 
 
 
319 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  44.41 
 
 
372 aa  263  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  47.4 
 
 
341 aa  263  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  40.99 
 
 
372 aa  263  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  44.78 
 
 
319 aa  263  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2620  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain H  42.77 
 
 
365 aa  262  4.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.146447 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 
458 aa  262  6e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.23 
 
 
337 aa  262  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  44.26 
 
 
316 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  42.03 
 
 
447 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  43.16 
 
 
447 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  41.3 
 
 
372 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  42.26 
 
 
341 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0638  NADH dehydrogenase I chain H  44.41 
 
 
372 aa  260  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1869  NADH dehydrogenase (quinone)  43.66 
 
 
372 aa  260  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  45.36 
 
 
328 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>