More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1758 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  100 
 
 
337 aa  664    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  78.04 
 
 
339 aa  502  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  71.87 
 
 
344 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  69.81 
 
 
340 aa  442  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  69.81 
 
 
340 aa  442  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  67.5 
 
 
340 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  67.19 
 
 
340 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  68.92 
 
 
354 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  70.62 
 
 
354 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  66.46 
 
 
343 aa  418  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  65.02 
 
 
352 aa  420  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0715  NADH dehydrogenase (quinone)  70.66 
 
 
354 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.567288  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  70.03 
 
 
339 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  64.91 
 
 
341 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  64.91 
 
 
341 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  64.62 
 
 
366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  60.12 
 
 
349 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  60.88 
 
 
357 aa  396  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  60.88 
 
 
357 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  63.61 
 
 
349 aa  391  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0276  NADH dehydrogenase subunit H  60.42 
 
 
363 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  59.57 
 
 
354 aa  391  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0247  NADH dehydrogenase subunit H  60.42 
 
 
363 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  59.57 
 
 
354 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  58.05 
 
 
354 aa  388  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2824  NADH dehydrogenase subunit H  59.64 
 
 
364 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00869776  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  61.09 
 
 
347 aa  388  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01294  NADH dehydrogenase subunit H  59.52 
 
 
363 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  60.55 
 
 
354 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  61.4 
 
 
359 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  61.95 
 
 
354 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  60.24 
 
 
354 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  57.88 
 
 
354 aa  378  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  60.24 
 
 
333 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  60.24 
 
 
354 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  60.24 
 
 
352 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2806  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  60.73 
 
 
360 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  60.55 
 
 
354 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  60.24 
 
 
352 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  61.32 
 
 
354 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  60.24 
 
 
354 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  60.24 
 
 
352 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  59.88 
 
 
358 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  56.46 
 
 
354 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  59.21 
 
 
358 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  59.02 
 
 
352 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  58.28 
 
 
337 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  60.06 
 
 
355 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  57.65 
 
 
358 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0964  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  58.36 
 
 
358 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.890655  normal  0.0815435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0879  NADH dehydrogenase (quinone)  58.36 
 
 
358 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  59.43 
 
 
355 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  59.43 
 
 
355 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  59.43 
 
 
355 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  61.44 
 
 
355 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  61.44 
 
 
355 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  61.44 
 
 
355 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2002  NADH dehydrogenase subunit H  59.75 
 
 
354 aa  358  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.4994  normal  0.0583966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  53.42 
 
 
343 aa  355  5e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1500  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  55.02 
 
 
360 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  57.65 
 
 
338 aa  350  3e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  56.44 
 
 
341 aa  342  5.999999999999999e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  51.35 
 
 
369 aa  330  2e-89  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  52.96 
 
 
341 aa  329  3e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1302  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  53.25 
 
 
347 aa  325  5e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656687  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  50.88 
 
 
367 aa  325  8.000000000000001e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  49.85 
 
 
341 aa  322  6e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  51.36 
 
 
349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  51.33 
 
 
349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  50.15 
 
 
349 aa  320  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3219  NADH dehydrogenase subunit H  51.3 
 
 
337 aa  315  6e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  50.61 
 
 
348 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  52.36 
 
 
322 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4626  NADH dehydrogenase subunit H  51.8 
 
 
339 aa  311  7.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0842951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2391  NADH dehydrogenase subunit H  50.48 
 
 
342 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.0000491536  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2581  NADH dehydrogenase subunit H  48.15 
 
 
341 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.393278  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.69 
 
 
337 aa  309  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0054  NADH dehydrogenase I, H subunit  51.06 
 
 
336 aa  309  5e-83  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  51.23 
 
 
410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2878  NADH dehydrogenase subunit H  49.52 
 
 
341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.171106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4133  NADH dehydrogenase subunit H  50.96 
 
 
340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1207  NADH dehydrogenase subunit H  49.09 
 
 
340 aa  305  6e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1078  NADH dehydrogenase subunit H  49.09 
 
 
340 aa  305  6e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.425523 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  47.34 
 
 
364 aa  305  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1012  NADH dehydrogenase subunit H  49.09 
 
 
340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2293  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  52.8 
 
 
347 aa  303  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1880  NADH dehydrogenase subunit H  46.95 
 
 
356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.517536  normal  0.265736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2411  NADH dehydrogenase subunit H  50.81 
 
 
341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2052  NADH dehydrogenase subunit H  47.58 
 
 
340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2925  NADH dehydrogenase subunit H  51.69 
 
 
342 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1268  NADH dehydrogenase subunit H  48.56 
 
 
347 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.279404  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  51.47 
 
 
472 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3291  NADH dehydrogenase subunit H  50.32 
 
 
341 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347185  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1721  NADH dehydrogenase subunit H  49.2 
 
 
347 aa  299  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1360  NADH dehydrogenase subunit H  48.56 
 
 
347 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0549439  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2213  NADH dehydrogenase subunit H  46.65 
 
 
356 aa  298  8e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0909649  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  49.07 
 
 
341 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.84 
 
 
349 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  49.39 
 
 
416 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  49.39 
 
 
416 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>