More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2159 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 		 355 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  95.18 
 
 		 354 aa  674    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  94.87 
 
 		 352 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  94.87 
 
 		 352 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  97.18 
 
 		 355 aa  669    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  95.75 
 
 		 354 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  94.87 
 
 		 352 aa  669    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  97.46 
 
 		 355 aa  654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  97.75 
 
 		 355 aa  672    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  97.46 
 
 		 355 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  95.18 
 
 		 354 aa  674    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 		 355 aa  697    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  95.18 
 
 		 354 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  97.46 
 
 		 355 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  95.18 
 
 		 333 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  89.24 
 
 		 354 aa  624  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  88.95 
 
 		 354 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2002  NADH dehydrogenase subunit H  89.24 
 
 		 354 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.4994  normal  0.0583966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  75.35 
 
 		 354 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  75.07 
 
 		 354 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  73.37 
 
 		 354 aa  534  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  72.8 
 
 		 354 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  71.39 
 
 		 354 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  69.66 
 
 		 357 aa  510  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  69.66 
 
 		 357 aa  510  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  66.19 
 
 		 352 aa  496  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  65.44 
 
 		 354 aa  480  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  63.31 
 
 		 358 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  63.69 
 
 		 359 aa  471  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  65.88 
 
 		 347 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  62.75 
 
 		 358 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0964  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  62.46 
 
 		 358 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.890655  normal  0.0815435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0879  NADH dehydrogenase (quinone)  62.18 
 
 		 358 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  61.9 
 
 		 358 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2806  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  61.84 
 
 		 360 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1500  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  59.61 
 
 		 360 aa  448  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  63.61 
 
 		 349 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  61.99 
 
 		 349 aa  441  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  63.39 
 
 		 341 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  63.39 
 
 		 341 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  60.66 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  60.87 
 
 		 352 aa  391  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  61.31 
 
 		 339 aa  391  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2824  NADH dehydrogenase subunit H  59.46 
 
 		 364 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00869776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  59.65 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01294  NADH dehydrogenase subunit H  57.52 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  56.21 
 
 		 366 aa  381  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  57.36 
 
 		 340 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  57.06 
 
 		 340 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0276  NADH dehydrogenase subunit H  58.26 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0247  NADH dehydrogenase subunit H  58.26 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  53.35 
 
 		 343 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  58.54 
 
 		 340 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  58.54 
 
 		 340 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  61.14 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  57.49 
 
 		 337 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  54.73 
 
 		 339 aa  355  5e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  56.41 
 
 		 354 aa  355  5.999999999999999e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0715  NADH dehydrogenase (quinone)  58.82 
 
 		 354 aa  352  5e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.567288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  53.8 
 
 		 337 aa  351  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  52.25 
 
 		 369 aa  342  5e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  52.99 
 
 		 341 aa  339  5e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  51.81 
 
 		 367 aa  337  9.999999999999999e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  56.45 
 
 		 338 aa  334  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  53.23 
 
 		 341 aa  331  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0804  NADH dehydrogenase subunit H  55.52 
 
 		 347 aa  325  8.000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3219  NADH dehydrogenase subunit H  52.94 
 
 		 337 aa  325  8.000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2416  NADH dehydrogenase subunit H  55.18 
 
 		 347 aa  324  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792289  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0809  NADH dehydrogenase subunit H  55.52 
 
 		 347 aa  324  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519776  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1302  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.44 
 
 		 347 aa  323  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656687  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  48.4 
 
 		 349 aa  322  6e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.4 
 
 		 349 aa  322  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2581  NADH dehydrogenase subunit H  49.54 
 
 		 341 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.393278  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1029  NADH dehydrogenase subunit H  51.69 
 
 		 347 aa  319  6e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182867  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0054  NADH dehydrogenase I, H subunit  51.23 
 
 		 336 aa  318  7e-86  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1721  NADH dehydrogenase subunit H  49.7 
 
 		 347 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0897  NADH dehydrogenase subunit H  50 
 
 		 347 aa  315  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0785  NADH dehydrogenase subunit H  51.61 
 
 		 348 aa  315  8e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.181346  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1880  NADH dehydrogenase subunit H  49.55 
 
 		 356 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.517536  normal  0.265736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2213  NADH dehydrogenase subunit H  50.15 
 
 		 356 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0909649  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1360  NADH dehydrogenase subunit H  48.48 
 
 		 347 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0549439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2878  NADH dehydrogenase subunit H  49.24 
 
 		 341 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.171106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2052  NADH dehydrogenase subunit H  49.38 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4626  NADH dehydrogenase subunit H  50.65 
 
 		 339 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0842951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1268  NADH dehydrogenase subunit H  49.35 
 
 		 347 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.279404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2293  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.29 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1012  NADH dehydrogenase subunit H  50.47 
 
 		 340 aa  309  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4397  NADH dehydrogenase subunit H  51.95 
 
 		 340 aa  309  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4133  NADH dehydrogenase subunit H  51.96 
 
 		 340 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1078  NADH dehydrogenase subunit H  49.84 
 
 		 340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.425523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1207  NADH dehydrogenase subunit H  49.84 
 
 		 340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.15 
 
 		 337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2925  NADH dehydrogenase subunit H  51.17 
 
 		 342 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  48.79 
 
 		 341 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  43.63 
 
 		 364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2391  NADH dehydrogenase subunit H  49.85 
 
 		 342 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.0000491536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  48.53 
 
 		 349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  47.22 
 
 		 348 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4554  NADH dehydrogenase subunit H  47.6 
 
 		 356 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3291  NADH dehydrogenase subunit H  50.82 
 
 		 341 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>