More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4003 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
349 aa  705    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  98.57 
 
 
349 aa  700    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  85.75 
 
 
349 aa  599  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  85.96 
 
 
348 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  86.87 
 
 
337 aa  586  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  72.57 
 
 
364 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  56.23 
 
 
322 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  51.93 
 
 
341 aa  339  5e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.91 
 
 
337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  52.42 
 
 
343 aa  334  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  51.82 
 
 
329 aa  333  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  50.3 
 
 
330 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  51.04 
 
 
413 aa  328  6e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  52.89 
 
 
410 aa  328  7e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  52.79 
 
 
329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  51.36 
 
 
329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.03 
 
 
331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  51.37 
 
 
369 aa  326  3e-88  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  50.61 
 
 
438 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.01 
 
 
354 aa  324  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  51.34 
 
 
411 aa  324  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
341 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  50 
 
 
341 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  47.89 
 
 
345 aa  322  5e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  49.54 
 
 
345 aa  322  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  50.61 
 
 
367 aa  322  6e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  50.3 
 
 
430 aa  321  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  47.59 
 
 
451 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  48.68 
 
 
354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  51.06 
 
 
330 aa  319  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  48.09 
 
 
354 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  51.68 
 
 
343 aa  319  6e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  48.97 
 
 
354 aa  318  9e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  50.75 
 
 
341 aa  318  1e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  48.39 
 
 
352 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  52.45 
 
 
447 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  48.39 
 
 
352 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  48.39 
 
 
352 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  51.37 
 
 
330 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  48.39 
 
 
354 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  48.39 
 
 
354 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  48.39 
 
 
333 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  48.39 
 
 
354 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  48.69 
 
 
355 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  49.55 
 
 
416 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  49.55 
 
 
416 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  49.55 
 
 
416 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  48.37 
 
 
340 aa  316  3e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  48.4 
 
 
355 aa  316  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  48.4 
 
 
355 aa  316  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  49.7 
 
 
357 aa  315  6e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  48.97 
 
 
355 aa  315  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  48.96 
 
 
352 aa  315  9e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  48.37 
 
 
340 aa  314  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.04 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.24 
 
 
357 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  50.81 
 
 
328 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  45.14 
 
 
359 aa  312  4.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  48.55 
 
 
384 aa  312  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  48.48 
 
 
447 aa  312  5.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  52.7 
 
 
449 aa  311  7.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.75 
 
 
348 aa  311  9e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  50.91 
 
 
462 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  49.55 
 
 
355 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  49.55 
 
 
355 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  49.55 
 
 
355 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  49.1 
 
 
433 aa  310  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.9 
 
 
339 aa  310  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  45.58 
 
 
342 aa  310  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.58 
 
 
339 aa  311  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  49.4 
 
 
354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.11 
 
 
389 aa  309  4e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  48.48 
 
 
486 aa  308  6.999999999999999e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  48.88 
 
 
441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  47.2 
 
 
349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  45.18 
 
 
350 aa  306  4.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0054  NADH dehydrogenase I, H subunit  50.3 
 
 
336 aa  306  4.0000000000000004e-82  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  47.46 
 
 
354 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  46.18 
 
 
358 aa  305  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  47.46 
 
 
354 aa  305  6e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  49.3 
 
 
354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  47.38 
 
 
340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2002  NADH dehydrogenase subunit H  47.62 
 
 
354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.4994  normal  0.0583966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  47.31 
 
 
354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  47.38 
 
 
340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.79 
 
 
349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.16 
 
 
344 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.45 
 
 
337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  49.54 
 
 
472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  46.57 
 
 
354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.97 
 
 
347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  44.78 
 
 
353 aa  302  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  48.78 
 
 
458 aa  302  6.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  48.14 
 
 
447 aa  302  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  51.82 
 
 
449 aa  301  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  45.43 
 
 
357 aa  300  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  49.39 
 
 
441 aa  299  4e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.98 
 
 
354 aa  299  4e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  48.35 
 
 
448 aa  299  5e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  44.71 
 
 
352 aa  299  6e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>