More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0848 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1869  NADH dehydrogenase (quinone)  90.59 
 
 		 372 aa  676    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  90.86 
 
 		 372 aa  672    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0638  NADH dehydrogenase I chain H  89.25 
 
 		 372 aa  665    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 372 aa  734    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0965  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  90.32 
 
 		 372 aa  664    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00465289  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  84.64 
 
 		 372 aa  630  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0846  NADH dehydrogenase (quinone)  85.91 
 
 		 368 aa  622  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.637242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2443  NADH dehydrogenase (quinone)  52.81 
 
 		 360 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3616  NADH dehydrogenase (quinone)  54.71 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.537864  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2620  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain H  48.6 
 
 		 365 aa  350  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.146447 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2575  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.94 
 
 		 464 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1273  NADH dehydrogenase (quinone)  44.47 
 
 		 464 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1285  NADH dehydrogenase (quinone)  45.68 
 
 		 455 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.853788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1374  NADH dehydrogenase (quinone)  44.2 
 
 		 464 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26363  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  47.13 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  45.79 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  45.79 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1027  hypothetical protein  41.86 
 
 		 351 aa  272  7e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  44.94 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.24 
 
 		 348 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.73 
 
 		 349 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  47.24 
 
 		 341 aa  268  8e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  41.16 
 
 		 349 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  45.02 
 
 		 349 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  41.16 
 
 		 349 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0266  NADH dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 		 419 aa  264  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571273  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  44.9 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.14 
 
 		 337 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.41 
 
 		 329 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  43.5 
 
 		 348 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  45.11 
 
 		 340 aa  262  8e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  44.27 
 
 		 333 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  41.24 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  45.43 
 
 		 340 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  41.71 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  43.95 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  43.95 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  43.95 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  43.95 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  43.95 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  43.95 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  43.95 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  43.95 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  43.63 
 
 		 333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  41 
 
 		 349 aa  259  6e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.02 
 
 		 347 aa  259  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  43.71 
 
 		 322 aa  258  9e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.89 
 
 		 349 aa  258  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  45.16 
 
 		 341 aa  257  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  42.9 
 
 		 350 aa  256  6e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  40.5 
 
 		 440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  43.52 
 
 		 372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  42.39 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.08 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  45.89 
 
 		 338 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  39.13 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  39.77 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.44 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.5 
 
 		 357 aa  249  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  42.22 
 
 		 345 aa  249  6e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  38.42 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  39.71 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  41.89 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  41.07 
 
 		 372 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1500  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.94 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0276  NADH dehydrogenase subunit H  44.28 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  38.16 
 
 		 372 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 		 452 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  40.35 
 
 		 359 aa  246  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  43.3 
 
 		 352 aa  246  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0247  NADH dehydrogenase subunit H  44.28 
 
 		 363 aa  246  3e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  40.41 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  41.37 
 
 		 372 aa  246  4.9999999999999997e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  43.03 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  41.74 
 
 		 357 aa  246  6e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  40.41 
 
 		 354 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  41.69 
 
 		 355 aa  246  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  42.72 
 
 		 333 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.68 
 
 		 366 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  42.72 
 
 		 352 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.86 
 
 		 337 aa  245  8e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  42.47 
 
 		 354 aa  245  8e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  44.74 
 
 		 341 aa  245  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  42.72 
 
 		 352 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  42.72 
 
 		 352 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  44.74 
 
 		 341 aa  245  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  41.69 
 
 		 355 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  43.61 
 
 		 353 aa  245  9e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  42.72 
 
 		 354 aa  245  9e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2806  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.42 
 
 		 360 aa  245  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  42.72 
 
 		 354 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.27 
 
 		 337 aa  245  9e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  42.72 
 
 		 354 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  41.69 
 
 		 355 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  41.4 
 
 		 355 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.28 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  39.23 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01294  NADH dehydrogenase subunit H  41.74 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  41.21 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.41 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>