More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1042 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
407 aa  813    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  60.6 
 
 
390 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  60.35 
 
 
391 aa  464  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  54.57 
 
 
357 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  47.38 
 
 
341 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  47.16 
 
 
342 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.66 
 
 
337 aa  302  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  47.51 
 
 
348 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  45.35 
 
 
349 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  46.21 
 
 
417 aa  297  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  47.63 
 
 
349 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  47.04 
 
 
349 aa  295  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  48.3 
 
 
449 aa  295  8e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  42.2 
 
 
359 aa  294  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  47.46 
 
 
364 aa  293  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  44.17 
 
 
345 aa  293  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  47.75 
 
 
472 aa  292  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  43.62 
 
 
415 aa  291  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  46.11 
 
 
462 aa  290  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  45.43 
 
 
384 aa  290  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.22 
 
 
389 aa  290  4e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  46.31 
 
 
341 aa  287  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  44.35 
 
 
345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  45.11 
 
 
447 aa  286  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  43.08 
 
 
353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  46.2 
 
 
486 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  46.26 
 
 
329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.84 
 
 
337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  47.26 
 
 
416 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  47.26 
 
 
416 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  47.26 
 
 
416 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  43.92 
 
 
353 aa  282  6.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  47.76 
 
 
433 aa  282  8.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  43.75 
 
 
330 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  42.82 
 
 
441 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.75 
 
 
354 aa  280  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  40.87 
 
 
353 aa  279  5e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  46.15 
 
 
451 aa  278  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  45.4 
 
 
420 aa  278  1e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  46.55 
 
 
466 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  47.52 
 
 
430 aa  276  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  47.08 
 
 
410 aa  276  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  49.38 
 
 
411 aa  276  7e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  43.93 
 
 
369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2766  NADH dehydrogenase subunit H  43.41 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  42.51 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  45.29 
 
 
367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  44.28 
 
 
341 aa  273  3e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1498  NADH dehydrogenase subunit H  43.68 
 
 
324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  42.46 
 
 
325 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  42.46 
 
 
325 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  42.46 
 
 
325 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  42.46 
 
 
325 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  42.46 
 
 
325 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.64 
 
 
343 aa  272  7e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  47.27 
 
 
413 aa  272  9e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  41.25 
 
 
350 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.51 
 
 
331 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.82 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  47.34 
 
 
458 aa  270  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.38 
 
 
329 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  41.48 
 
 
325 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.65 
 
 
348 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  40.4 
 
 
354 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  42.48 
 
 
322 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  45.98 
 
 
449 aa  266  7e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  40.4 
 
 
354 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  40.56 
 
 
322 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  43.97 
 
 
317 aa  265  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  42.51 
 
 
440 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  40.66 
 
 
325 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  40.66 
 
 
325 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  40.66 
 
 
325 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  40.66 
 
 
325 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  40.66 
 
 
325 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  40.66 
 
 
325 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  40.66 
 
 
325 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  40.66 
 
 
325 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3371  NADH dehydrogenase I, H subunit  42.62 
 
 
335 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3203  NADH dehydrogenase subunit H  42.62 
 
 
335 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0243703  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  42.53 
 
 
316 aa  263  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0375  NADH-quinone oxidoreductase, chain H  41.08 
 
 
321 aa  263  4e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  42.2 
 
 
355 aa  263  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  41.62 
 
 
355 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  41.62 
 
 
355 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  41.01 
 
 
354 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  47.2 
 
 
441 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  43.97 
 
 
330 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  42 
 
 
352 aa  261  1e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4125  NADH dehydrogenase subunit H  42.23 
 
 
335 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  44.89 
 
 
438 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  41.33 
 
 
355 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  42.49 
 
 
354 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1740  NADH dehydrogenase subunit H  42.23 
 
 
335 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0467697  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3697  NADH dehydrogenase subunit H  42.23 
 
 
335 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.116468  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1867  NADH dehydrogenase subunit H  42.23 
 
 
335 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0487349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  46.6 
 
 
447 aa  259  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  41.19 
 
 
354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  42.07 
 
 
341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  41.79 
 
 
354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>