More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6675 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 		 447 aa  884    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  61.43 
 
 		 441 aa  536  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  57.76 
 
 		 486 aa  480  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  65.32 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  59 
 
 		 447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  59.53 
 
 		 449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  55.61 
 
 		 466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  57.97 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  60 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  60.1 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  60.1 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  59.19 
 
 		 411 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  58.25 
 
 		 410 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  57.62 
 
 		 451 aa  435  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  57.66 
 
 		 472 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  55.64 
 
 		 413 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  58.25 
 
 		 430 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  56 
 
 		 438 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  52.45 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  57.45 
 
 		 449 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  53.44 
 
 		 448 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  54.91 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  54.3 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  54.3 
 
 		 452 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  53.01 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  48.98 
 
 		 448 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  49.55 
 
 		 452 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5060  NADH dehydrogenase (quinone)  49.89 
 
 		 457 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  50.9 
 
 		 441 aa  375  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  50.5 
 
 		 445 aa  361  1e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  53.03 
 
 		 420 aa  339  5e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  54.37 
 
 		 329 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  50.57 
 
 		 364 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  51.23 
 
 		 341 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  52.45 
 
 		 349 aa  319  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  51.82 
 
 		 349 aa  319  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  52.53 
 
 		 329 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 		 329 aa  316  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  54.4 
 
 		 348 aa  316  6e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  54.4 
 
 		 337 aa  315  8e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  47.8 
 
 		 330 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  46.88 
 
 		 357 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  50.94 
 
 		 330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  50.63 
 
 		 330 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  49.36 
 
 		 390 aa  309  6.999999999999999e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  48.73 
 
 		 391 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  48.49 
 
 		 349 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  52.81 
 
 		 389 aa  301  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.48 
 
 		 344 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  47.38 
 
 		 352 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  47.38 
 
 		 352 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  47.38 
 
 		 352 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  47.76 
 
 		 354 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  47.76 
 
 		 354 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  47.76 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  48.09 
 
 		 415 aa  298  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  47.76 
 
 		 354 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  47.38 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  47.53 
 
 		 355 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  46.71 
 
 		 342 aa  291  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  47.37 
 
 		 355 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  48.56 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  48.56 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  47.15 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  47.15 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  48.56 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  48.55 
 
 		 341 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  44.86 
 
 		 353 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  48.55 
 
 		 341 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  45.71 
 
 		 353 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.83 
 
 		 331 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  46.25 
 
 		 367 aa  286  5e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  45.81 
 
 		 369 aa  286  5.999999999999999e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.5 
 
 		 337 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.42 
 
 		 357 aa  286  8e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  46.29 
 
 		 354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  46.95 
 
 		 354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  48.38 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  44.29 
 
 		 353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.92 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  45.23 
 
 		 359 aa  283  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.93 
 
 		 349 aa  282  7.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  45.29 
 
 		 407 aa  282  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.82 
 
 		 329 aa  282  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  44.97 
 
 		 345 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  47.95 
 
 		 357 aa  281  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  44.74 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  47.08 
 
 		 340 aa  280  4e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  47.27 
 
 		 352 aa  280  4e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.07 
 
 		 339 aa  280  4e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.71 
 
 		 339 aa  279  6e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  43.82 
 
 		 354 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  45.73 
 
 		 341 aa  279  8e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  47.37 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.34 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  46.75 
 
 		 340 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  46.27 
 
 		 354 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  46.27 
 
 		 354 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  47.34 
 
 		 340 aa  277  3e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  47.34 
 
 		 340 aa  277  3e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>