More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07450 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 		 447 aa  894    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  73.32 
 
 		 436 aa  641    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  73.55 
 
 		 458 aa  624  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  74.88 
 
 		 445 aa  619  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  69.86 
 
 		 441 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  58.69 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  60.24 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  55.58 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  52.86 
 
 		 472 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  54.34 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  55.39 
 
 		 413 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  52.21 
 
 		 438 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  55.85 
 
 		 416 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  55.61 
 
 		 416 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  56.3 
 
 		 411 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  55.94 
 
 		 410 aa  418  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  55.61 
 
 		 416 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  50.62 
 
 		 486 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  60.12 
 
 		 462 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  51.73 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  51.25 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  54.84 
 
 		 451 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  56.45 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  53.42 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  54.61 
 
 		 449 aa  398  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  53.92 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  50.11 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5060  NADH dehydrogenase (quinone)  52.59 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  47.07 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  50.83 
 
 		 452 aa  383  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.78 
 
 		 389 aa  309  5e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  48.82 
 
 		 417 aa  307  3e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  47.88 
 
 		 369 aa  306  6e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  47.73 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  47.08 
 
 		 341 aa  301  2e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  48.04 
 
 		 420 aa  299  8e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  49.85 
 
 		 329 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  47.86 
 
 		 364 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  48.07 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  45.28 
 
 		 415 aa  294  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.66 
 
 		 349 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48 
 
 		 354 aa  289  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.06 
 
 		 337 aa  289  7e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  48.78 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.9 
 
 		 343 aa  288  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  49.38 
 
 		 348 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.7 
 
 		 344 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.06 
 
 		 329 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.38 
 
 		 337 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  45.31 
 
 		 338 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  45.48 
 
 		 354 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  45.48 
 
 		 354 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.2 
 
 		 349 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  46.65 
 
 		 349 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  47.65 
 
 		 330 aa  279  9e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  45.19 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  48.75 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  45.75 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  46.88 
 
 		 329 aa  276  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  45.45 
 
 		 330 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.68 
 
 		 331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  44.74 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  44.61 
 
 		 352 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  44.74 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  44.61 
 
 		 352 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  44.74 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  44.95 
 
 		 341 aa  274  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  44.61 
 
 		 352 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  44.81 
 
 		 333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  44.44 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  43.01 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.25 
 
 		 357 aa  273  5.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  44.74 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  43.68 
 
 		 354 aa  272  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  44.14 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 		 353 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  43.84 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  43.95 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  43.41 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  43.53 
 
 		 355 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  43.57 
 
 		 352 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  44.14 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  44.14 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  43.98 
 
 		 357 aa  267  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  43.82 
 
 		 355 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.93 
 
 		 366 aa  266  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  43.82 
 
 		 355 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  43.82 
 
 		 355 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  44.74 
 
 		 352 aa  266  5.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2581  NADH dehydrogenase subunit H  42.06 
 
 		 341 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.393278  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  43.73 
 
 		 322 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.13 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  44.14 
 
 		 354 aa  263  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  44.83 
 
 		 341 aa  263  6e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  44.83 
 
 		 341 aa  263  6e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  44.44 
 
 		 340 aa  263  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  42.82 
 
 		 354 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.12 
 
 		 347 aa  263  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  44.15 
 
 		 349 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  44.14 
 
 		 354 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>