More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1276 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 415 aa  812    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  70.46 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  63.44 
 
 		 389 aa  393  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  47.34 
 
 		 451 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  45.99 
 
 		 433 aa  305  7e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  47.08 
 
 		 462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  47.72 
 
 		 430 aa  303  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  47.84 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  50.58 
 
 		 357 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  48.26 
 
 		 348 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  49.52 
 
 		 349 aa  298  8e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  44.62 
 
 		 486 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  48.09 
 
 		 447 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  49.21 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.96 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.77 
 
 		 337 aa  296  6e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  48.14 
 
 		 341 aa  295  8e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  46.43 
 
 		 410 aa  295  9e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  50.62 
 
 		 330 aa  294  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  46.78 
 
 		 447 aa  293  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  52.61 
 
 		 330 aa  292  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  46.53 
 
 		 364 aa  292  8e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  46.02 
 
 		 458 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  47.54 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  47.54 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  47.54 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  47.34 
 
 		 413 aa  290  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  45.01 
 
 		 447 aa  290  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  51.63 
 
 		 330 aa  289  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  45.73 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  50.64 
 
 		 329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  46.73 
 
 		 369 aa  286  4e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  45.75 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  47.65 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  45.95 
 
 		 407 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  48.21 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  43.52 
 
 		 472 aa  282  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  47.02 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  45.95 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  46.04 
 
 		 367 aa  281  2e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  45.59 
 
 		 436 aa  280  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  46.65 
 
 		 349 aa  280  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  46.42 
 
 		 340 aa  279  8e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.48 
 
 		 329 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  44.89 
 
 		 391 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  46.53 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  44.88 
 
 		 466 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.44 
 
 		 343 aa  276  5e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  50.66 
 
 		 329 aa  276  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  40.91 
 
 		 452 aa  275  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.23 
 
 		 354 aa  275  9e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.31 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  45.19 
 
 		 341 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  46.01 
 
 		 441 aa  272  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  44.27 
 
 		 447 aa  272  9e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  48.24 
 
 		 322 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  42.2 
 
 		 449 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0054  NADH dehydrogenase I, H subunit  48.54 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  48.18 
 
 		 341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.34 
 
 		 349 aa  270  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  48.39 
 
 		 420 aa  270  4e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  43.85 
 
 		 335 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  41.06 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3697  NADH dehydrogenase subunit H  45.67 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.116468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2418  NADH dehydrogenase subunit H  47 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.68011  normal  0.208608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1867  NADH dehydrogenase subunit H  45.67 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0487349 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  45.81 
 
 		 341 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1078  NADH dehydrogenase subunit H  45.45 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.425523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1207  NADH dehydrogenase subunit H  45.45 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  45.81 
 
 		 341 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  46.6 
 
 		 338 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  43.15 
 
 		 354 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  43.15 
 
 		 354 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2766  NADH dehydrogenase subunit H  46.65 
 
 		 324 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1498  NADH dehydrogenase subunit H  46.96 
 
 		 324 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  47.62 
 
 		 353 aa  266  5e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  44.94 
 
 		 352 aa  266  5.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.24 
 
 		 366 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  45.48 
 
 		 448 aa  266  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  47 
 
 		 325 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  47 
 
 		 325 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  47 
 
 		 325 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  47 
 
 		 325 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  47 
 
 		 325 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1012  NADH dehydrogenase subunit H  45.54 
 
 		 340 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  42.52 
 
 		 342 aa  265  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  46.37 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  46.37 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  44.89 
 
 		 353 aa  265  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  43.45 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  43.04 
 
 		 345 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  46.37 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  44.81 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  46.37 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  46.37 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  46.69 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  45.17 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  46.37 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  46.37 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  46.37 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>