More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7684 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 472 aa  946    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  64.49 
 
 		 430 aa  546  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  63.45 
 
 		 433 aa  536  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  61.37 
 
 		 416 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  61.37 
 
 		 416 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  61.37 
 
 		 416 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  61.15 
 
 		 411 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  62.8 
 
 		 410 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  59.48 
 
 		 438 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  68.39 
 
 		 462 aa  482  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  58.78 
 
 		 413 aa  479  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  54.7 
 
 		 486 aa  478  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  53.81 
 
 		 458 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  63.38 
 
 		 449 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  59.51 
 
 		 452 aa  462  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  56.7 
 
 		 449 aa  462  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  55.83 
 
 		 451 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  55.91 
 
 		 447 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5060  NADH dehydrogenase (quinone)  55.56 
 
 		 457 aa  448  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  54.7 
 
 		 447 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  55.37 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  57 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  51.97 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  51.51 
 
 		 452 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  56.64 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  54.98 
 
 		 466 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  53.41 
 
 		 448 aa  431  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  51.64 
 
 		 448 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  53.88 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  50.68 
 
 		 441 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  52.84 
 
 		 420 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  49.56 
 
 		 364 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  47.09 
 
 		 341 aa  318  9e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.79 
 
 		 344 aa  317  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  49.11 
 
 		 349 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.52 
 
 		 349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  46.09 
 
 		 349 aa  309  8e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.88 
 
 		 343 aa  309  8e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  47.69 
 
 		 348 aa  309  9e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.49 
 
 		 349 aa  306  6e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.3 
 
 		 337 aa  306  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  44.94 
 
 		 369 aa  302  7.000000000000001e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.2 
 
 		 347 aa  299  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  47.66 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.68 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  49.39 
 
 		 340 aa  298  1e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  49.39 
 
 		 340 aa  298  1e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  45.88 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.39 
 
 		 339 aa  296  5e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.18 
 
 		 329 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  46.5 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  46.51 
 
 		 341 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.32 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  46.51 
 
 		 341 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  49.07 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  47.89 
 
 		 354 aa  293  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  43.94 
 
 		 367 aa  293  6e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  47.59 
 
 		 354 aa  293  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  46.31 
 
 		 354 aa  292  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  47.29 
 
 		 355 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  47.65 
 
 		 407 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  45.03 
 
 		 357 aa  291  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  46.63 
 
 		 352 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  46.63 
 
 		 354 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  46.63 
 
 		 333 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  46.63 
 
 		 352 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  46.63 
 
 		 354 aa  290  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  46.63 
 
 		 354 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  46.63 
 
 		 354 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  46.63 
 
 		 352 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  43.21 
 
 		 354 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  43.98 
 
 		 354 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  43.98 
 
 		 354 aa  290  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  46.2 
 
 		 340 aa  288  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  47.71 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  44.26 
 
 		 354 aa  288  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  46.44 
 
 		 358 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  45.86 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  46.31 
 
 		 352 aa  288  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  45.29 
 
 		 354 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  43.84 
 
 		 341 aa  286  4e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0879  NADH dehydrogenase (quinone)  47.2 
 
 		 358 aa  287  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.04 
 
 		 358 aa  286  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  46.99 
 
 		 355 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  46.99 
 
 		 355 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  45.29 
 
 		 417 aa  286  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  45.59 
 
 		 352 aa  286  7e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  43.52 
 
 		 415 aa  285  9e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  45.57 
 
 		 340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  44.29 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0964  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.34 
 
 		 358 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.890655  normal  0.0815435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.86 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.66 
 
 		 389 aa  283  5.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  44.51 
 
 		 322 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2806  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.32 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.84 
 
 		 354 aa  282  8.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  42.41 
 
 		 390 aa  282  8.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.73 
 
 		 366 aa  282  9e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.16 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.66 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>