More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0545 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 		 449 aa  886    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  80.48 
 
 		 462 aa  691    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  62.32 
 
 		 430 aa  479  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  61.2 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  57.61 
 
 		 486 aa  477  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  59.12 
 
 		 416 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  59.12 
 
 		 416 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  59.12 
 
 		 416 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  64.06 
 
 		 472 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  67.25 
 
 		 410 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  67.93 
 
 		 447 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  63.41 
 
 		 411 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  56.02 
 
 		 438 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  63.51 
 
 		 451 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  65.08 
 
 		 447 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  56.22 
 
 		 441 aa  441  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  56.72 
 
 		 413 aa  444  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  63.33 
 
 		 452 aa  435  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  58.92 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  59.64 
 
 		 466 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  50.9 
 
 		 448 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  52.12 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5060  NADH dehydrogenase (quinone)  54.22 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  61.95 
 
 		 447 aa  411  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  52.44 
 
 		 452 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  62.46 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  53.83 
 
 		 447 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  59.54 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  53.18 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  53.81 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  54.43 
 
 		 420 aa  340  4e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  52.4 
 
 		 341 aa  324  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  52.68 
 
 		 329 aa  322  8e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  51.82 
 
 		 349 aa  316  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  51.52 
 
 		 349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  49.55 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  52.66 
 
 		 329 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  49.7 
 
 		 349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  47.27 
 
 		 330 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  51.43 
 
 		 348 aa  307  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  52.08 
 
 		 337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  47.46 
 
 		 357 aa  305  9.000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.95 
 
 		 344 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  49.69 
 
 		 329 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  45.95 
 
 		 415 aa  301  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.79 
 
 		 389 aa  300  4e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  51.89 
 
 		 340 aa  299  7e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  51.89 
 
 		 340 aa  299  7e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  44.93 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.23 
 
 		 343 aa  296  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  49.07 
 
 		 330 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.09 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  49.07 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  47.16 
 
 		 417 aa  293  6e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  44.61 
 
 		 369 aa  292  9e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  48.46 
 
 		 341 aa  290  4e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.82 
 
 		 354 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.69 
 
 		 339 aa  286  5e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  45.93 
 
 		 342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  46.49 
 
 		 341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  46.49 
 
 		 341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.66 
 
 		 331 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.68 
 
 		 348 aa  282  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.88 
 
 		 366 aa  280  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  45.88 
 
 		 407 aa  280  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  42.15 
 
 		 391 aa  279  8e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.33 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  46.27 
 
 		 340 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  42.65 
 
 		 345 aa  277  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.83 
 
 		 354 aa  276  6e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.85 
 
 		 337 aa  276  7e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.37 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  42.78 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  42.78 
 
 		 353 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  45.05 
 
 		 340 aa  274  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  45.96 
 
 		 317 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  42.99 
 
 		 322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  41.41 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  43.32 
 
 		 353 aa  274  3e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  44.01 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1156  NADH dehydrogenase (quinone)  46.89 
 
 		 348 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.94 
 
 		 347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  46.63 
 
 		 343 aa  273  7e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  45.1 
 
 		 349 aa  272  7e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  50.16 
 
 		 352 aa  272  7e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  42.98 
 
 		 354 aa  272  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  46.5 
 
 		 333 aa  272  9e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  47.04 
 
 		 341 aa  270  4e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  45.66 
 
 		 333 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  45.66 
 
 		 333 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  45.66 
 
 		 333 aa  270  4e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  45.66 
 
 		 333 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  45.98 
 
 		 333 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  45.05 
 
 		 333 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  45.66 
 
 		 333 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  45.66 
 
 		 333 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2866  NADH dehydrogenase (quinone)  47.57 
 
 		 317 aa  270  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473976  normal  0.0334094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  45.66 
 
 		 333 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  45.66 
 
 		 333 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>