More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1239 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 350 aa  712    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  66.47 
 
 		 359 aa  484  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  67.16 
 
 		 345 aa  474  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  65.19 
 
 		 345 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  64.29 
 
 		 342 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  61.89 
 
 		 384 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  44.29 
 
 		 349 aa  317  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  45.85 
 
 		 348 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  44.25 
 
 		 349 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  43.68 
 
 		 349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.23 
 
 		 337 aa  305  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3864  NADH dehydrogenase (quinone)  46.9 
 
 		 390 aa  300  3e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  44.27 
 
 		 330 aa  299  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  42.31 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  44.07 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  43.41 
 
 		 328 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  43.06 
 
 		 341 aa  296  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  45.37 
 
 		 390 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.29 
 
 		 329 aa  290  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  45.21 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  42.55 
 
 		 341 aa  286  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  44.14 
 
 		 330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  43.83 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.51 
 
 		 331 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  43.73 
 
 		 340 aa  278  7e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  42.37 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  42.06 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  41.81 
 
 		 357 aa  277  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  44.1 
 
 		 340 aa  275  6e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.93 
 
 		 354 aa  275  7e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1156  NADH dehydrogenase (quinone)  44.34 
 
 		 348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.2 
 
 		 344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  44.51 
 
 		 441 aa  272  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  42.19 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  42.99 
 
 		 413 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  40.62 
 
 		 451 aa  270  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  43.08 
 
 		 341 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  43.08 
 
 		 341 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  41.46 
 
 		 420 aa  269  7e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  42.42 
 
 		 410 aa  267  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0145  NADH dehydrogenase (quinone)  41.94 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000869539  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  40.9 
 
 		 447 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  43.57 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0479  NADH dehydrogenase (quinone)  39.84 
 
 		 414 aa  264  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  40.94 
 
 		 462 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  42.62 
 
 		 472 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  41.46 
 
 		 430 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.94 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.95 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.42 
 
 		 343 aa  263  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.72 
 
 		 339 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  40.64 
 
 		 318 aa  262  8e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  41.39 
 
 		 407 aa  261  8.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  41.8 
 
 		 458 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1610  NADH dehydrogenase (quinone)  37.84 
 
 		 422 aa  261  1e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.297282  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  40.51 
 
 		 466 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.31 
 
 		 337 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1522  NADH dehydrogenase subunit H  42.64 
 
 		 330 aa  260  3e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000672667  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  41.36 
 
 		 340 aa  260  3e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  36.62 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  41.36 
 
 		 340 aa  260  3e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  41.14 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.24 
 
 		 329 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  40.62 
 
 		 433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  42.12 
 
 		 416 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  42.12 
 
 		 416 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  42.12 
 
 		 416 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  36.75 
 
 		 372 aa  258  8e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  37.54 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  36.24 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  41.89 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  38.94 
 
 		 486 aa  257  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  35.96 
 
 		 384 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  40.12 
 
 		 417 aa  256  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0965  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.42 
 
 		 372 aa  256  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00465289  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.66 
 
 		 366 aa  256  6e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.07 
 
 		 349 aa  255  8e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  41.43 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  40.41 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0635  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.25 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.25 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3186  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.25 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  40.81 
 
 		 333 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  40.41 
 
 		 372 aa  252  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  41.43 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  38.86 
 
 		 441 aa  252  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  35.61 
 
 		 372 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  39.88 
 
 		 367 aa  252  8.000000000000001e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  37.98 
 
 		 352 aa  251  9.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0188  NADH dehydrogenase subunit H  40.24 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0846  NADH dehydrogenase (quinone)  41.18 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.637242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  42.39 
 
 		 445 aa  251  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1290  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.19 
 
 		 426 aa  251  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.673572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  40.5 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  40.5 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  40.5 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  40.5 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  39.88 
 
 		 369 aa  251  2e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  40.5 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  40.5 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>