More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1290 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1290  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  100 
 
 
426 aa  847    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.673572  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  48.77 
 
 
341 aa  280  4e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0715  NADH dehydrogenase (quinone)  44.53 
 
 
354 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.567288  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  40.2 
 
 
352 aa  276  6e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  39.42 
 
 
430 aa  269  8.999999999999999e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  51.33 
 
 
348 aa  266  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  48.81 
 
 
349 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.22 
 
 
344 aa  264  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.81 
 
 
349 aa  264  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.67 
 
 
337 aa  263  3e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  38.24 
 
 
357 aa  264  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.74 
 
 
343 aa  263  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  43.2 
 
 
354 aa  263  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.19 
 
 
337 aa  263  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  40.79 
 
 
340 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  38.89 
 
 
448 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  39.34 
 
 
447 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  38.19 
 
 
438 aa  260  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  47.99 
 
 
364 aa  260  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  40.91 
 
 
486 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  40.64 
 
 
416 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  40.64 
 
 
416 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  40.64 
 
 
416 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  39.29 
 
 
367 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  47.3 
 
 
349 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  39.89 
 
 
433 aa  258  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  51.03 
 
 
322 aa  257  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  40.53 
 
 
340 aa  256  5e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  40.53 
 
 
340 aa  256  5e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  36.28 
 
 
440 aa  256  7e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  39.18 
 
 
458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.38 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  37.9 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  38.46 
 
 
452 aa  253  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  37.75 
 
 
372 aa  250  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  39.5 
 
 
447 aa  250  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.49 
 
 
347 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  46.76 
 
 
447 aa  249  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  37.5 
 
 
372 aa  249  8e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  37.91 
 
 
372 aa  249  9e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  36.73 
 
 
384 aa  249  9e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3616  NADH dehydrogenase (quinone)  39.36 
 
 
361 aa  247  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.537864  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  36.86 
 
 
384 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  36.27 
 
 
372 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  38.32 
 
 
341 aa  247  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.94 
 
 
329 aa  247  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  48.08 
 
 
353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  37.41 
 
 
372 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  47.69 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  36.41 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.26 
 
 
331 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  49.27 
 
 
451 aa  243  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  47.69 
 
 
353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  36.66 
 
 
372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  37.06 
 
 
350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  37.22 
 
 
391 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  50.99 
 
 
338 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  48.46 
 
 
413 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2443  NADH dehydrogenase (quinone)  39.2 
 
 
360 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.6 
 
 
349 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0276  NADH dehydrogenase subunit H  36.84 
 
 
363 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0247  NADH dehydrogenase subunit H  36.84 
 
 
363 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  37.29 
 
 
358 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  36.27 
 
 
372 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  36.57 
 
 
372 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2824  NADH dehydrogenase subunit H  37.34 
 
 
364 aa  239  5.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00869776  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  48.29 
 
 
410 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  44.75 
 
 
411 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.03 
 
 
357 aa  239  8e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  48.12 
 
 
341 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  34.49 
 
 
448 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  45.33 
 
 
340 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  36.03 
 
 
372 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  48.12 
 
 
341 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  36.93 
 
 
407 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  45.42 
 
 
330 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  43.75 
 
 
357 aa  238  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  48.34 
 
 
355 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.29 
 
 
348 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  48.38 
 
 
447 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  36.32 
 
 
372 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  35.66 
 
 
417 aa  237  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  46.72 
 
 
343 aa  237  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  47.04 
 
 
462 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  35.78 
 
 
372 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  51.23 
 
 
341 aa  237  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1039  NADH dehydrogenase subunit H  36.32 
 
 
372 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000216191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  48.87 
 
 
329 aa  237  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  38.56 
 
 
420 aa  237  4e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  48.34 
 
 
355 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  48.34 
 
 
355 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  36.75 
 
 
390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  49.63 
 
 
319 aa  236  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  47.81 
 
 
354 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  46.36 
 
 
354 aa  236  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  46.03 
 
 
333 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  47.45 
 
 
354 aa  236  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  46.03 
 
 
354 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  46.03 
 
 
354 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  46.03 
 
 
354 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>