More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0145 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0145  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 330 aa  655    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000869539  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0188  NADH dehydrogenase subunit H  55.96 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1522  NADH dehydrogenase subunit H  61.11 
 
 		 330 aa  404  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000672667  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1438  NADH dehydrogenase subunit H  59.44 
 
 		 332 aa  402  1e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1663  NADH dehydrogenase subunit H  58.82 
 
 		 331 aa  395  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.418562  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1821  NADH dehydrogenase subunit H  62.78 
 
 		 328 aa  394  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000044114  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1557  NADH dehydrogenase subunit H  56.66 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000661956  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1743  NADH dehydrogenase subunit H  59 
 
 		 332 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.693854  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1923  NADH dehydrogenase subunit H  59.33 
 
 		 332 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0148771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  44.14 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  44.67 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  44.14 
 
 		 349 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  46.6 
 
 		 341 aa  280  4e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  44.14 
 
 		 349 aa  278  7e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.54 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  41.94 
 
 		 350 aa  272  7e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.55 
 
 		 343 aa  260  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  44.83 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  41.57 
 
 		 364 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  44.7 
 
 		 322 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  41.88 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  44.52 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  40.48 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.86 
 
 		 329 aa  250  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  43.87 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  44.52 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  44.52 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  44.52 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  44.52 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  44.52 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  44.52 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  44.52 
 
 		 333 aa  249  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  44.52 
 
 		 333 aa  249  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  44.52 
 
 		 333 aa  249  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.12 
 
 		 389 aa  248  7e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  40.59 
 
 		 345 aa  248  9e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  43.43 
 
 		 342 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.55 
 
 		 349 aa  245  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  44.19 
 
 		 333 aa  245  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.62 
 
 		 331 aa  246  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  41.96 
 
 		 415 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  43.85 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.37 
 
 		 337 aa  242  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.72 
 
 		 354 aa  242  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  42.54 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  41 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  42.68 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  39.76 
 
 		 335 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  42.54 
 
 		 330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  41.64 
 
 		 340 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  43.93 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  42.47 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  41.99 
 
 		 340 aa  239  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  41.77 
 
 		 341 aa  238  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.85 
 
 		 348 aa  238  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  41.77 
 
 		 341 aa  238  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  41.8 
 
 		 462 aa  238  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0758  NADH dehydrogenase (quinone)  40.85 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013576  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  42.24 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  39.23 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  39.82 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  41.19 
 
 		 372 aa  236  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  45.51 
 
 		 338 aa  237  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  40.88 
 
 		 384 aa  236  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  43.27 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  40.31 
 
 		 451 aa  235  9e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  41.61 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  41.61 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  41.3 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  41.12 
 
 		 349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  41.3 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0638  NADH dehydrogenase I chain H  39.52 
 
 		 372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  41.3 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  41.61 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  41.61 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  41.3 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  41.61 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  41.61 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  41.61 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  41.3 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  41.61 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.04 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  39.42 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0846  NADH dehydrogenase (quinone)  40.25 
 
 		 368 aa  233  3e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.637242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.37 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  42.2 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.38 
 
 		 339 aa  232  5e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  39.58 
 
 		 352 aa  232  6e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  42.19 
 
 		 317 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0879  NADH dehydrogenase (quinone)  40.55 
 
 		 358 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3203  NADH dehydrogenase subunit H  40.57 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0243703  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.03 
 
 		 358 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  40.55 
 
 		 430 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3371  NADH dehydrogenase I, H subunit  40.25 
 
 		 335 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.05 
 
 		 366 aa  229  5e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2418  NADH dehydrogenase subunit H  39.5 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.68011  normal  0.208608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2563  NADH dehydrogenase subunit H  40.43 
 
 		 331 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  39.09 
 
 		 358 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0965  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.25 
 
 		 372 aa  228  9e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00465289  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29930  NADH dehydrogenase subunit H  40.12 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>