More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0968 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0968  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  100 
 
 
321 aa  618  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3193  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  76.62 
 
 
332 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1881  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  66.46 
 
 
323 aa  424  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4505  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  58.54 
 
 
319 aa  338  8e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1421  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  56.56 
 
 
323 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245548  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0676  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  38.05 
 
 
338 aa  190  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2591  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  36.07 
 
 
343 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2226  NADH dehydrogenase (quinone)  34.77 
 
 
328 aa  153  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0960  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  34.01 
 
 
333 aa  151  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.298865  normal  0.545007 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1129  NADH dehydrogenase (quinone)  32.04 
 
 
322 aa  150  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0596  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.16 
 
 
313 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3523  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.73 
 
 
313 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0378  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  36.01 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000246514  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0317  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  36.91 
 
 
300 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.37 
 
 
348 aa  126  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1012  NADH dehydrogenase subunit H  33.33 
 
 
340 aa  125  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  33 
 
 
338 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1078  NADH dehydrogenase subunit H  33.33 
 
 
340 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.425523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1207  NADH dehydrogenase subunit H  33.33 
 
 
340 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0889  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  30.57 
 
 
300 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2052  NADH dehydrogenase subunit H  32.67 
 
 
340 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4397  NADH dehydrogenase subunit H  32.09 
 
 
340 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.55 
 
 
329 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0897  NADH dehydrogenase subunit H  31.91 
 
 
347 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4133  NADH dehydrogenase subunit H  32 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  28.2 
 
 
349 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  31.58 
 
 
322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1605  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  31.8 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  32.26 
 
 
330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1218  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.1 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  29.14 
 
 
440 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2785  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.88 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2793  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.88 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0187  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.18 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0785  NADH dehydrogenase subunit H  29.18 
 
 
348 aa  117  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.181346  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  30.03 
 
 
367 aa  117  3e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  30.52 
 
 
325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  30.52 
 
 
325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  30.52 
 
 
325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  30.52 
 
 
325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  30.52 
 
 
325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  30.52 
 
 
325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  30.52 
 
 
325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  30.52 
 
 
325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1360  NADH dehydrogenase subunit H  31.48 
 
 
347 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0549439  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  29.74 
 
 
335 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.45 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1721  NADH dehydrogenase subunit H  30.59 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4125  NADH dehydrogenase subunit H  28.99 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  27.71 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  29.64 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1740  NADH dehydrogenase subunit H  28.99 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0467697  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0804  NADH dehydrogenase subunit H  30.59 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  32.14 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.69 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1268  NADH dehydrogenase subunit H  31.15 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.279404  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2418  NADH dehydrogenase subunit H  30.18 
 
 
330 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.68011  normal  0.208608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3697  NADH dehydrogenase subunit H  29.74 
 
 
335 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.116468  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3203  NADH dehydrogenase subunit H  28.34 
 
 
335 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0243703  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2581  NADH dehydrogenase subunit H  30.67 
 
 
341 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.393278  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2878  NADH dehydrogenase subunit H  30.67 
 
 
341 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.171106 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1867  NADH dehydrogenase subunit H  29.74 
 
 
335 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0487349 
 
 
-
 
NC_004310  BR0809  NADH dehydrogenase subunit H  30.59 
 
 
347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519776  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3371  NADH dehydrogenase I, H subunit  28.34 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  31.25 
 
 
333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  30.92 
 
 
333 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  30.92 
 
 
333 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  30.92 
 
 
333 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  30.92 
 
 
333 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  30.92 
 
 
333 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  30.92 
 
 
333 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2416  NADH dehydrogenase subunit H  30.59 
 
 
347 aa  113  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792289  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2391  NADH dehydrogenase subunit H  31.1 
 
 
342 aa  112  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.0000491536  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  30.92 
 
 
333 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  30.92 
 
 
333 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  30.19 
 
 
325 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  30.19 
 
 
325 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  30.19 
 
 
325 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  30.19 
 
 
325 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  30.19 
 
 
325 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1880  NADH dehydrogenase subunit H  29.74 
 
 
356 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.517536  normal  0.265736 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1740  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  30.27 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2766  NADH dehydrogenase subunit H  29.13 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02167  hypothetical protein  30.43 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  29.85 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  30.92 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  30.55 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28500  NADH dehydrogenase subunit H  29.97 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.325342  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1073  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.93 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.781085  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1566  NADH dehydrogenase subunit H  30.33 
 
 
325 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2866  NADH dehydrogenase (quinone)  32.51 
 
 
317 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473976  normal  0.0334094 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  29.91 
 
 
353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  29.91 
 
 
353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.65 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  30.59 
 
 
333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  28.12 
 
 
349 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0054  NADH dehydrogenase I, H subunit  31.05 
 
 
336 aa  109  5e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  30.74 
 
 
329 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1810  NADH dehydrogenase subunit H  30 
 
 
325 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.639781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1460  NADH dehydrogenase subunit H  30 
 
 
325 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>