More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0676 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0676  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  100 
 
 
338 aa  669    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2591  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  52.13 
 
 
343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0960  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  51.53 
 
 
333 aa  295  5e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.298865  normal  0.545007 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3193  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  38.66 
 
 
332 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1881  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  37.3 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3523  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.56 
 
 
313 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0968  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.91 
 
 
321 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4505  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.02 
 
 
319 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1421  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  32.44 
 
 
323 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0596  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.65 
 
 
313 aa  165  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1129  NADH dehydrogenase (quinone)  33.01 
 
 
322 aa  151  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2226  NADH dehydrogenase (quinone)  33.54 
 
 
328 aa  149  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0378  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  34.36 
 
 
321 aa  142  7e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000246514  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0317  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  36.06 
 
 
300 aa  136  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2785  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.65 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2793  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.65 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0187  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.8 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  31.43 
 
 
338 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  30.51 
 
 
440 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  28.85 
 
 
340 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.97 
 
 
329 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  28.85 
 
 
340 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3023  ech hydrogenase subunit B  35.07 
 
 
291 aa  122  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0539405  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1293  F420H2 dehydrogenase subunit H  30.03 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000183992  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2190  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.63 
 
 
313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.552986 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  28.21 
 
 
348 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  28.48 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  29.75 
 
 
341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  30.36 
 
 
390 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  29.48 
 
 
372 aa  116  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  28.57 
 
 
331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1605  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  29.64 
 
 
293 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  27.16 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  27.76 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  25.4 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2616  hydrogenase-4 component C  31.49 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  29.53 
 
 
364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1186  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  31.17 
 
 
315 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4985  NADH dehydrogenase (quinone)  27.12 
 
 
413 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.101143  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  31.06 
 
 
333 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3705  hydrogenase-4 component C  31.49 
 
 
315 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438396  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1218  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.43 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  29.41 
 
 
369 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2443  NADH dehydrogenase (quinone)  29.46 
 
 
360 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  28.41 
 
 
349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0889  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  30.46 
 
 
300 aa  113  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  28.41 
 
 
349 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  28.16 
 
 
372 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  30.59 
 
 
451 aa  113  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  25.56 
 
 
353 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  29.11 
 
 
352 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.11 
 
 
344 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  27.41 
 
 
330 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  29.28 
 
 
372 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  28.34 
 
 
354 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  29.11 
 
 
372 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  28.31 
 
 
348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  28.52 
 
 
354 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  30.43 
 
 
333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  28.96 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  28.61 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  29.38 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  28.97 
 
 
372 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0638  NADH dehydrogenase I chain H  28.85 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  27 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  28.53 
 
 
357 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  29.87 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  27 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  28.97 
 
 
372 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0846  NADH dehydrogenase (quinone)  27.35 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.637242  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  29.1 
 
 
354 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  28.21 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  27.49 
 
 
372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  30.43 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  30.43 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  29.6 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  27.27 
 
 
384 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  30.43 
 
 
333 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  30.43 
 
 
333 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  30.43 
 
 
333 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  30.43 
 
 
333 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  30.43 
 
 
333 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  29.1 
 
 
354 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  30.43 
 
 
333 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  28.97 
 
 
372 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  27.7 
 
 
452 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  30.43 
 
 
333 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0758  NADH dehydrogenase (quinone)  30.35 
 
 
348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013576  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  30.82 
 
 
333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2994  NADH dehydrogenase (quinone)  27.37 
 
 
452 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.960029  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  28.03 
 
 
349 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2855  hydrogenase-4 component C  30.84 
 
 
314 aa  109  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2765  hydrogenase-4 component C  31.17 
 
 
314 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0881  NADH dehydrogenase (quinone)  29.18 
 
 
336 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000223152  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0025  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.82 
 
 
285 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.610569  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0965  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  28.86 
 
 
372 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00465289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  27.99 
 
 
358 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.27 
 
 
366 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  29.45 
 
 
342 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  29.24 
 
 
372 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>