More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1293 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1293  F420H2 dehydrogenase subunit H  100 
 
 
344 aa  674    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000183992  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3408  F420H2 dehydrogenase subunit H  72.89 
 
 
346 aa  471  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00645372  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1053  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  55.02 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  42.82 
 
 
372 aa  268  8.999999999999999e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  44.94 
 
 
372 aa  265  7e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  46.73 
 
 
353 aa  262  6.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  46.13 
 
 
353 aa  261  1e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  44.24 
 
 
372 aa  260  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  41.83 
 
 
372 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  45.2 
 
 
353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.04 
 
 
348 aa  258  8e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  43.45 
 
 
372 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  42.41 
 
 
372 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  42.12 
 
 
372 aa  256  6e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  44.44 
 
 
372 aa  252  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  44.13 
 
 
372 aa  252  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  44.13 
 
 
372 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  41.55 
 
 
384 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  41.84 
 
 
372 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  42.19 
 
 
372 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  41.88 
 
 
372 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1039  NADH dehydrogenase subunit H  41.88 
 
 
372 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000216191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.61 
 
 
329 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  41.43 
 
 
384 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.78 
 
 
349 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  43.14 
 
 
328 aa  239  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.14 
 
 
331 aa  239  5.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  41.96 
 
 
329 aa  235  9e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  43.29 
 
 
333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  42.76 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  43.1 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  42.76 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  39.04 
 
 
359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  42.76 
 
 
333 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  42.76 
 
 
333 aa  233  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  42.76 
 
 
333 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  42.76 
 
 
333 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  42.76 
 
 
333 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  42.76 
 
 
333 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  42.76 
 
 
333 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  42.76 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  40.53 
 
 
342 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  41.85 
 
 
317 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  42.59 
 
 
330 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  42.27 
 
 
330 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  39.24 
 
 
341 aa  229  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  43.64 
 
 
319 aa  229  7e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2866  NADH dehydrogenase (quinone)  43.6 
 
 
317 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473976  normal  0.0334094 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.82 
 
 
329 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  41.32 
 
 
333 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3819  NADH dehydrogenase (quinone)  42.07 
 
 
318 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.32 
 
 
337 aa  226  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0881  NADH dehydrogenase (quinone)  40.31 
 
 
336 aa  226  6e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000223152  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  38.03 
 
 
349 aa  225  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  39.81 
 
 
348 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  41.2 
 
 
316 aa  224  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  40.23 
 
 
329 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  41.47 
 
 
322 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  39.93 
 
 
351 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  38.21 
 
 
384 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  40.6 
 
 
335 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  41.08 
 
 
322 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  42.49 
 
 
330 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4125  NADH dehydrogenase subunit H  43.67 
 
 
335 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  42.43 
 
 
369 aa  222  6e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1740  NADH dehydrogenase subunit H  43.67 
 
 
335 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0467697  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  37.22 
 
 
438 aa  222  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0280  NADH dehydrogenase subunit H  40.66 
 
 
373 aa  222  9e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  36.56 
 
 
458 aa  222  9e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2412  NADH dehydrogenase subunit H  40.66 
 
 
373 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  39.03 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  39.07 
 
 
449 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  35.92 
 
 
350 aa  220  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  42.57 
 
 
417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0749  NADH dehydrogenase (quinone)  36.67 
 
 
337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0374707  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  38.71 
 
 
349 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  39.16 
 
 
364 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  40.26 
 
 
341 aa  219  5e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3203  NADH dehydrogenase subunit H  41.67 
 
 
335 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0243703  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3371  NADH dehydrogenase I, H subunit  41.67 
 
 
335 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1867  NADH dehydrogenase subunit H  42.95 
 
 
335 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0487349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3697  NADH dehydrogenase subunit H  42.95 
 
 
335 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.116468  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3126  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.57 
 
 
328 aa  218  8.999999999999998e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  38.21 
 
 
451 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  41.56 
 
 
318 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  38.79 
 
 
341 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2563  NADH dehydrogenase subunit H  40.71 
 
 
331 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0375  NADH-quinone oxidoreductase, chain H  42.17 
 
 
321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 
349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29930  NADH dehydrogenase subunit H  40.38 
 
 
331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  42.43 
 
 
367 aa  216  4e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3864  NADH dehydrogenase (quinone)  36.42 
 
 
390 aa  216  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  36.27 
 
 
452 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  41.8 
 
 
338 aa  216  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4065  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.34 
 
 
324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0444558  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  41.08 
 
 
415 aa  215  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4985  NADH dehydrogenase (quinone)  35.65 
 
 
413 aa  215  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.101143  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  37.24 
 
 
440 aa  215  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  35.53 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  36.76 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>