More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1053 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1053  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  100 
 
 		 350 aa  693    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1293  F420H2 dehydrogenase subunit H  55.35 
 
 		 344 aa  334  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000183992  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3408  F420H2 dehydrogenase subunit H  52.12 
 
 		 346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00645372  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  45.28 
 
 		 353 aa  273  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  46.54 
 
 		 353 aa  272  7e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  46.86 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.97 
 
 		 331 aa  266  5.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  45.82 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.12 
 
 		 348 aa  256  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  45.15 
 
 		 333 aa  255  9e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  45.15 
 
 		 333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  45.15 
 
 		 333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  45.15 
 
 		 333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  43.41 
 
 		 330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  45.15 
 
 		 333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  45.15 
 
 		 333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  45.15 
 
 		 333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  45.15 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  45.15 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  45.15 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  44.41 
 
 		 329 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  43.09 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  44.85 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.75 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  44.71 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  40.82 
 
 		 341 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  43.46 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  43.12 
 
 		 330 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  44.93 
 
 		 328 aa  235  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  43.12 
 
 		 330 aa  235  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  40.51 
 
 		 462 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  41.42 
 
 		 317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.13 
 
 		 337 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  43.63 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  43.9 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  40.13 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  40.06 
 
 		 359 aa  230  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0749  NADH dehydrogenase (quinone)  38.99 
 
 		 337 aa  229  7e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0374707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  39.06 
 
 		 364 aa  228  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  40 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  40 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  38.59 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  40.74 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  40.74 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  40.74 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  40.74 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  40.74 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  39.87 
 
 		 349 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  40.87 
 
 		 372 aa  226  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.47 
 
 		 349 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  38.65 
 
 		 372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0881  NADH dehydrogenase (quinone)  40.43 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000223152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3126  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.8 
 
 		 328 aa  226  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  39.54 
 
 		 349 aa  225  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  40.12 
 
 		 372 aa  225  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  40.62 
 
 		 325 aa  225  8e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  40.62 
 
 		 325 aa  225  8e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  40.62 
 
 		 325 aa  225  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  40.62 
 
 		 325 aa  225  8e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  40.62 
 
 		 325 aa  225  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  40.62 
 
 		 325 aa  225  8e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  40.62 
 
 		 325 aa  225  8e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  40.62 
 
 		 325 aa  225  8e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.87 
 
 		 343 aa  225  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  40.43 
 
 		 325 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  39.64 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2866  NADH dehydrogenase (quinone)  42.66 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473976  normal  0.0334094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  40.79 
 
 		 472 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  38.62 
 
 		 372 aa  223  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  40.19 
 
 		 342 aa  223  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2766  NADH dehydrogenase subunit H  44.34 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  40.59 
 
 		 322 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  39.04 
 
 		 384 aa  222  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  41.67 
 
 		 318 aa  222  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1693  NADH dehydrogenase subunit H  41.89 
 
 		 348 aa  222  9e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1498  NADH dehydrogenase subunit H  44.01 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  39.2 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  38.48 
 
 		 345 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0375  NADH-quinone oxidoreductase, chain H  42.09 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.19 
 
 		 329 aa  220  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  39.62 
 
 		 390 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  39.07 
 
 		 458 aa  219  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  40.18 
 
 		 372 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  39.88 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  37.9 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  38.7 
 
 		 372 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3819  NADH dehydrogenase (quinone)  40.48 
 
 		 318 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  39.14 
 
 		 349 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1353  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.32 
 
 		 319 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  38.96 
 
 		 372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  40.92 
 
 		 449 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0758  NADH dehydrogenase (quinone)  38.6 
 
 		 348 aa  216  4e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013576  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  40.61 
 
 		 407 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  37.91 
 
 		 372 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  38.66 
 
 		 420 aa  215  7e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  41.56 
 
 		 351 aa  215  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  40.2 
 
 		 341 aa  215  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  40.2 
 
 		 341 aa  215  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3203  NADH dehydrogenase subunit H  40.54 
 
 		 335 aa  215  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0243703  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3371  NADH dehydrogenase I, H subunit  40.54 
 
 		 335 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>