More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0280 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  85.6 
 
 
384 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0280  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 
373 aa  724    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  87.4 
 
 
384 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  83.6 
 
 
372 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  83.6 
 
 
372 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  83.6 
 
 
372 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2412  NADH dehydrogenase subunit H  95.17 
 
 
373 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  84.82 
 
 
372 aa  611  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  84.55 
 
 
372 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  84.28 
 
 
372 aa  594  1e-168  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  76.96 
 
 
372 aa  584  1e-166  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  74.19 
 
 
372 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  74.73 
 
 
372 aa  546  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  73.12 
 
 
372 aa  543  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  72.04 
 
 
372 aa  538  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  75.07 
 
 
372 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1039  NADH dehydrogenase subunit H  73.12 
 
 
372 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000216191 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  73.12 
 
 
372 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  42.69 
 
 
359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  43.96 
 
 
384 aa  276  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.81 
 
 
329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  43.21 
 
 
440 aa  272  6e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.02 
 
 
348 aa  270  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  42.43 
 
 
345 aa  270  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  45.87 
 
 
390 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  41.18 
 
 
341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  44.31 
 
 
391 aa  263  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  43.57 
 
 
353 aa  262  8.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  43.03 
 
 
353 aa  262  8.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  47.78 
 
 
333 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  39.82 
 
 
350 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  43.28 
 
 
353 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  44.11 
 
 
341 aa  260  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.72 
 
 
349 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  41 
 
 
345 aa  259  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  41.3 
 
 
342 aa  259  4e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  40.66 
 
 
348 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  46.2 
 
 
333 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  38.94 
 
 
349 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  45.89 
 
 
333 aa  256  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  45.89 
 
 
333 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  45.89 
 
 
333 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  45.89 
 
 
333 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  45.89 
 
 
333 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  45.89 
 
 
333 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3864  NADH dehydrogenase (quinone)  42.24 
 
 
390 aa  256  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  41.35 
 
 
349 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  45.89 
 
 
333 aa  256  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  45.89 
 
 
333 aa  256  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  40.61 
 
 
322 aa  256  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  40.32 
 
 
372 aa  256  5e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  40.17 
 
 
349 aa  256  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1869  NADH dehydrogenase (quinone)  39.78 
 
 
372 aa  256  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  45.89 
 
 
333 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  45.57 
 
 
333 aa  256  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2443  NADH dehydrogenase (quinone)  42.7 
 
 
360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.86 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0965  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.27 
 
 
372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00465289  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  41.88 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  39.13 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.76 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0846  NADH dehydrogenase (quinone)  41.67 
 
 
368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.637242  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  41.69 
 
 
372 aa  252  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.22 
 
 
331 aa  250  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  41.52 
 
 
372 aa  249  6e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3616  NADH dehydrogenase (quinone)  39.67 
 
 
361 aa  249  6e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.537864  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4985  NADH dehydrogenase (quinone)  37.96 
 
 
413 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.101143  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  39.07 
 
 
364 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  42.72 
 
 
329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0638  NADH dehydrogenase I chain H  40.4 
 
 
372 aa  245  8e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.72 
 
 
343 aa  245  9e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  39.87 
 
 
340 aa  243  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2620  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain H  38.72 
 
 
365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.146447 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  39.56 
 
 
340 aa  242  7e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  39.61 
 
 
451 aa  242  7e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  42.19 
 
 
330 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1290  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  36.66 
 
 
426 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.673572  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  40.54 
 
 
357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.29 
 
 
354 aa  240  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  41.88 
 
 
330 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  43.54 
 
 
333 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.69 
 
 
347 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  40.41 
 
 
420 aa  237  2e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.14 
 
 
366 aa  238  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  41.56 
 
 
330 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  42.5 
 
 
407 aa  237  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0758  NADH dehydrogenase (quinone)  41.27 
 
 
348 aa  237  3e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013576  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  38.35 
 
 
316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  40.56 
 
 
354 aa  235  8e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.3 
 
 
344 aa  235  8e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  40.56 
 
 
354 aa  235  9e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.8 
 
 
359 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1293  F420H2 dehydrogenase subunit H  39.53 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000183992  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  39.56 
 
 
354 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  40.44 
 
 
358 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  43.17 
 
 
447 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.3 
 
 
329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  38.64 
 
 
438 aa  233  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  41.18 
 
 
329 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  38.87 
 
 
452 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>