More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0889 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0889  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  100 
 
 
300 aa  595  1e-169  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1740  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  53.17 
 
 
291 aa  315  5e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1218  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  52.4 
 
 
293 aa  310  2e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1605  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  51.56 
 
 
293 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0378  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  41.9 
 
 
321 aa  202  5e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000246514  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2209  membrane bound protein complex subunit mbxM  33.22 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.152472 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1881  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  31.31 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3523  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.61 
 
 
313 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3193  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  28.05 
 
 
332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2226  NADH dehydrogenase (quinone)  28.21 
 
 
328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0968  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.86 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1421  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  28.57 
 
 
323 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  27.13 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1129  NADH dehydrogenase (quinone)  29.04 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4505  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.53 
 
 
319 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0676  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  30.13 
 
 
338 aa  108  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0960  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  28.62 
 
 
333 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.298865  normal  0.545007 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  30 
 
 
372 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  30 
 
 
372 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4985  NADH dehydrogenase (quinone)  27.21 
 
 
413 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.101143  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  30 
 
 
372 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2591  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.3 
 
 
343 aa  105  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  29.13 
 
 
372 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.16 
 
 
349 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  29.13 
 
 
372 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  28.26 
 
 
384 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  29.13 
 
 
372 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  28.26 
 
 
372 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  28.82 
 
 
372 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  27.46 
 
 
384 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1039  NADH dehydrogenase subunit H  26.64 
 
 
372 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000216191 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  26.64 
 
 
372 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4397  NADH dehydrogenase subunit H  27.36 
 
 
340 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  27.59 
 
 
372 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  26.2 
 
 
372 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.52 
 
 
348 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0280  NADH dehydrogenase subunit H  27.07 
 
 
373 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  31.65 
 
 
372 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0846  NADH dehydrogenase (quinone)  31.65 
 
 
368 aa  99.4  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.637242  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  27.39 
 
 
372 aa  99  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1012  NADH dehydrogenase subunit H  26.73 
 
 
340 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2785  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.89 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2793  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.89 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2412  NADH dehydrogenase subunit H  27.07 
 
 
373 aa  96.7  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1207  NADH dehydrogenase subunit H  26.42 
 
 
340 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0666  NADH dehydrogenase (quinone)  28.67 
 
 
317 aa  95.9  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.471376  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  26.72 
 
 
372 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0596  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  28.76 
 
 
313 aa  95.9  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1078  NADH dehydrogenase subunit H  26.42 
 
 
340 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.425523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3864  NADH dehydrogenase (quinone)  27.62 
 
 
390 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0317  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.51 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460489  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0747  NADH dehydrogenase (quinone)  30.08 
 
 
342 aa  94.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0758  NADH dehydrogenase (quinone)  27.22 
 
 
348 aa  94.4  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013576  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1721  NADH dehydrogenase subunit H  27.92 
 
 
347 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1293  F420H2 dehydrogenase subunit H  26.83 
 
 
344 aa  94  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000183992  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1053  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.32 
 
 
350 aa  93.2  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  29.57 
 
 
351 aa  92.8  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01294  NADH dehydrogenase subunit H  27.39 
 
 
363 aa  92.4  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3408  F420H2 dehydrogenase subunit H  25.97 
 
 
346 aa  92  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00645372  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  27.49 
 
 
341 aa  92.4  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2824  NADH dehydrogenase subunit H  26.67 
 
 
364 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00869776  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0276  NADH dehydrogenase subunit H  26.75 
 
 
363 aa  92  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0318  NADH dehydrogenase  26.92 
 
 
317 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.38198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2052  NADH dehydrogenase subunit H  25.59 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0247  NADH dehydrogenase subunit H  26.75 
 
 
363 aa  91.3  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  25.77 
 
 
353 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  27.46 
 
 
333 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4133  NADH dehydrogenase subunit H  26.35 
 
 
340 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1268  NADH dehydrogenase subunit H  26.56 
 
 
347 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.279404  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  28.81 
 
 
333 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  24.74 
 
 
353 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  28.81 
 
 
333 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0280  NADH dehydrogenase  39.55 
 
 
432 aa  89.4  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000247954 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  28.81 
 
 
333 aa  89  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  28.81 
 
 
333 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  28.81 
 
 
333 aa  89  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  28.81 
 
 
333 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  28.81 
 
 
333 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1920  NADH dehydrogenase (quinone)  25.68 
 
 
351 aa  89.4  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.179258  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  28.81 
 
 
333 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0897  NADH dehydrogenase subunit H  26.95 
 
 
347 aa  89  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  29.24 
 
 
333 aa  89  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  28.39 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  28.81 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1597  NADH dehydrogenase (quinone)  30.04 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  30.13 
 
 
372 aa  89  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  24.49 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1869  NADH dehydrogenase (quinone)  29.71 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  30.13 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0965  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.11 
 
 
372 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00465289  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  28.86 
 
 
440 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1360  NADH dehydrogenase subunit H  25.9 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0549439  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0163  NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 1 (NAD(P)hdehydrogenase I, chain 1)  25.81 
 
 
425 aa  87.4  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0266  NADH dehydrogenase (quinone)  27.35 
 
 
419 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571273  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2620  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain H  25.58 
 
 
365 aa  86.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.146447 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0638  NADH dehydrogenase I chain H  29.54 
 
 
372 aa  86.7  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4065  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.87 
 
 
324 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0444558  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  26.03 
 
 
349 aa  86.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  27.89 
 
 
341 aa  86.3  6e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4554  NADH dehydrogenase subunit H  25.73 
 
 
356 aa  85.9  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>