More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0747 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0747  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
342 aa  681    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.58 
 
 
329 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1597  NADH dehydrogenase (quinone)  50.7 
 
 
324 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  41.8 
 
 
349 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.23 
 
 
348 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.12 
 
 
349 aa  269  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  41.36 
 
 
350 aa  262  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  43.65 
 
 
340 aa  260  3e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  43.65 
 
 
340 aa  260  3e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.65 
 
 
339 aa  259  4e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  43.13 
 
 
341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  43.13 
 
 
341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  42.11 
 
 
333 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  42.11 
 
 
354 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  42.11 
 
 
354 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  42.4 
 
 
354 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  42.11 
 
 
354 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  42.11 
 
 
352 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  42.11 
 
 
352 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  42.11 
 
 
352 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  42.31 
 
 
355 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  42.31 
 
 
355 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  42.31 
 
 
355 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  40.95 
 
 
340 aa  256  5e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  41.27 
 
 
340 aa  256  6e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  40.12 
 
 
354 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  42.72 
 
 
355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  42.72 
 
 
355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  42.72 
 
 
355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  40.41 
 
 
354 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  43.03 
 
 
354 aa  252  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  43.03 
 
 
354 aa  252  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  41.42 
 
 
355 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.43 
 
 
344 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  40.69 
 
 
352 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  42.47 
 
 
351 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  41.81 
 
 
354 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.02 
 
 
347 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  42.06 
 
 
354 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  42.06 
 
 
354 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  41.51 
 
 
354 aa  249  6e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  38.72 
 
 
348 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  41.67 
 
 
343 aa  247  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.8 
 
 
337 aa  247  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  39.4 
 
 
349 aa  245  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.57 
 
 
358 aa  245  6e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  43.77 
 
 
329 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  39.14 
 
 
359 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.3 
 
 
359 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  37.38 
 
 
353 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  38.01 
 
 
353 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.4 
 
 
331 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.06 
 
 
349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.21 
 
 
366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  37.07 
 
 
353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  36.42 
 
 
349 aa  242  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  40.9 
 
 
358 aa  241  9e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  37.99 
 
 
349 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0879  NADH dehydrogenase (quinone)  42.9 
 
 
358 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  37.69 
 
 
349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  41.27 
 
 
345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.69 
 
 
357 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
357 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  39.12 
 
 
372 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  40.99 
 
 
358 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.12 
 
 
354 aa  238  8e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0964  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.27 
 
 
358 aa  238  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.890655  normal  0.0815435 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  38.76 
 
 
322 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  42.36 
 
 
330 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  40.69 
 
 
384 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2806  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.82 
 
 
360 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  38.8 
 
 
372 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2002  NADH dehydrogenase subunit H  41.07 
 
 
354 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.4994  normal  0.0583966 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  40.13 
 
 
372 aa  236  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  39.33 
 
 
345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  39.44 
 
 
372 aa  235  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40 
 
 
339 aa  235  8e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.09 
 
 
343 aa  235  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  39.75 
 
 
384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1500  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.5 
 
 
360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  39.25 
 
 
372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  39.23 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  38.49 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0965  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.06 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00465289  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  38.49 
 
 
372 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  38.17 
 
 
372 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3864  NADH dehydrogenase (quinone)  39.7 
 
 
390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.12 
 
 
354 aa  232  5e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.09 
 
 
337 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  38.72 
 
 
384 aa  232  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0638  NADH dehydrogenase I chain H  38.02 
 
 
372 aa  231  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2443  NADH dehydrogenase (quinone)  37.14 
 
 
360 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  38.17 
 
 
372 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  39.37 
 
 
341 aa  230  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2824  NADH dehydrogenase subunit H  38.58 
 
 
364 aa  230  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00869776  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  37.32 
 
 
372 aa  230  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0881  NADH dehydrogenase (quinone)  38.65 
 
 
336 aa  230  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000223152  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0715  NADH dehydrogenase (quinone)  39.94 
 
 
354 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.567288  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  37.58 
 
 
364 aa  229  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2620  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain H  35.59 
 
 
365 aa  229  7e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.146447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>