More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0280 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0280  NADH dehydrogenase  100 
 
 		 432 aa  828    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000247954 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  41.36 
 
 		 322 aa  233  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  41.82 
 
 		 333 aa  230  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  41.51 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  41.51 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  41.51 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  41.51 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  41.51 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  41.19 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  41.51 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  41.19 
 
 		 333 aa  227  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  41.19 
 
 		 333 aa  227  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  40.88 
 
 		 333 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  39.1 
 
 		 440 aa  219  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  37.99 
 
 		 353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  37.39 
 
 		 353 aa  216  8e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  37.08 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  38.24 
 
 		 349 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  38.73 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.99 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  37.74 
 
 		 372 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  40.06 
 
 		 333 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  39.76 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.82 
 
 		 331 aa  208  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  39.81 
 
 		 372 aa  206  8e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  39.51 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  36.97 
 
 		 329 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  39.51 
 
 		 372 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  38.67 
 
 		 329 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  37.61 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  37.99 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.62 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3819  NADH dehydrogenase (quinone)  38.71 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  35.24 
 
 		 330 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  37.65 
 
 		 384 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.3 
 
 		 331 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  39.94 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  37.92 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.74 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0318  NADH dehydrogenase  36.1 
 
 		 317 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4133  NADH dehydrogenase subunit H  35.28 
 
 		 340 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  36.59 
 
 		 317 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1207  NADH dehydrogenase subunit H  36.47 
 
 		 340 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  35.37 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1078  NADH dehydrogenase subunit H  36.47 
 
 		 340 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.425523 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  38.31 
 
 		 338 aa  196  7e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.99 
 
 		 343 aa  196  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0666  NADH dehydrogenase (quinone)  35.58 
 
 		 317 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.471376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1012  NADH dehydrogenase subunit H  36.18 
 
 		 340 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1039  NADH dehydrogenase subunit H  38.99 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216191 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  38.99 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.65 
 
 		 329 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2052  NADH dehydrogenase subunit H  33.82 
 
 		 340 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  39.31 
 
 		 372 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  37.93 
 
 		 372 aa  193  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4397  NADH dehydrogenase subunit H  34.91 
 
 		 340 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  34.69 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  37.24 
 
 		 341 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  33.62 
 
 		 349 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  38.39 
 
 		 318 aa  190  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  37.08 
 
 		 329 aa  190  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.88 
 
 		 337 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1998  NADH dehydrogenase subunit H  36.28 
 
 		 345 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.222188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  37.83 
 
 		 351 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1920  NADH dehydrogenase (quinone)  35.24 
 
 		 351 aa  190  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.179258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2925  NADH dehydrogenase subunit H  36.62 
 
 		 342 aa  190  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4626  NADH dehydrogenase subunit H  37.04 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0842951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1721  NADH dehydrogenase subunit H  35.31 
 
 		 347 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3219  NADH dehydrogenase subunit H  35.89 
 
 		 337 aa  189  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2581  NADH dehydrogenase subunit H  34.91 
 
 		 341 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.393278  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  33.05 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2522  NADH dehydrogenase subunit H  36.98 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  33.88 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2878  NADH dehydrogenase subunit H  34.91 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.171106 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2412  NADH dehydrogenase subunit H  39.23 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1184  NADH dehydrogenase subunit H  36.98 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.503975  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  34.94 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1114  NADH dehydrogenase subunit H  36.72 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  39.74 
 
 		 319 aa  187  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  36.48 
 
 		 322 aa  186  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4554  NADH dehydrogenase subunit H  34.58 
 
 		 356 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2411  NADH dehydrogenase subunit H  35.54 
 
 		 341 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1293  F420H2 dehydrogenase subunit H  36.68 
 
 		 344 aa  186  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000183992  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  36.99 
 
 		 372 aa  186  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  35.56 
 
 		 330 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  35.56 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1268  NADH dehydrogenase subunit H  34.72 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.279404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  36.87 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  35.56 
 
 		 330 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  35.42 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0280  NADH dehydrogenase subunit H  38.31 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1500  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.67 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1597  NADH dehydrogenase (quinone)  36.18 
 
 		 324 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2391  NADH dehydrogenase subunit H  33.92 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.0000491536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1360  NADH dehydrogenase subunit H  34.42 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0549439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  35.26 
 
 		 372 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0897  NADH dehydrogenase subunit H  35.61 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4985  NADH dehydrogenase (quinone)  34.27 
 
 		 413 aa  184  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.101143  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  36.53 
 
 		 367 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  35.99 
 
 		 322 aa  183  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000000126936  hitchhiker  0.00000000866182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>