More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1073 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1073  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  100 
 
 
322 aa  624  1e-178  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.781085  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0596  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.11 
 
 
313 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3523  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.78 
 
 
313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1129  NADH dehydrogenase (quinone)  35.67 
 
 
322 aa  158  9e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2226  NADH dehydrogenase (quinone)  34.56 
 
 
328 aa  154  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  33.33 
 
 
348 aa  149  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.74 
 
 
337 aa  142  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4505  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.23 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  33.33 
 
 
316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.27 
 
 
329 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  32.59 
 
 
372 aa  139  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  34.19 
 
 
341 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  32.91 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  31.74 
 
 
349 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  34.65 
 
 
330 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  34.97 
 
 
329 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  32.59 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  31.14 
 
 
349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3193  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  33.75 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  33.99 
 
 
330 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  31.27 
 
 
372 aa  134  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  32.44 
 
 
330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  31.25 
 
 
420 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  31.63 
 
 
384 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  32.88 
 
 
353 aa  132  5e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  32.25 
 
 
372 aa  132  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  34.82 
 
 
372 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  32.53 
 
 
353 aa  132  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.45 
 
 
348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  32.23 
 
 
329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  31.85 
 
 
353 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  31.86 
 
 
417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  32.04 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  32.01 
 
 
451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  31.31 
 
 
372 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  31.31 
 
 
372 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  31.31 
 
 
372 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  31.31 
 
 
372 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  32.88 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0747  NADH dehydrogenase (quinone)  32.52 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4985  NADH dehydrogenase (quinone)  30.65 
 
 
413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.101143  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.33 
 
 
389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  30.62 
 
 
349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2866  NADH dehydrogenase (quinone)  31.07 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473976  normal  0.0334094 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0881  NADH dehydrogenase (quinone)  32.53 
 
 
336 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000223152  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  32.12 
 
 
433 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  29.45 
 
 
384 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  29.77 
 
 
415 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1290  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.51 
 
 
426 aa  125  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.673572  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  32.88 
 
 
322 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  30.38 
 
 
349 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  30.39 
 
 
372 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1039  NADH dehydrogenase subunit H  30.39 
 
 
372 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000216191 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  30.39 
 
 
372 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  34.01 
 
 
333 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  32.21 
 
 
447 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.99 
 
 
329 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  31.16 
 
 
351 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0666  NADH dehydrogenase (quinone)  35.29 
 
 
317 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.471376  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  32.02 
 
 
438 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  27.88 
 
 
440 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  32.09 
 
 
340 aa  123  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  32.09 
 
 
340 aa  123  5e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3371  NADH dehydrogenase I, H subunit  28.52 
 
 
335 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3203  NADH dehydrogenase subunit H  28.52 
 
 
335 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0243703  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  33.11 
 
 
322 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000000126936  hitchhiker  0.00000000866182 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1920  NADH dehydrogenase (quinone)  33.22 
 
 
351 aa  122  9e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.179258  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  28.99 
 
 
345 aa  122  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4125  NADH dehydrogenase subunit H  28.52 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  33.68 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  33.68 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  34.03 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  33.68 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  28.16 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  33.68 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  33.68 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  30.5 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  33.68 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5972  NADH dehydrogenase (quinone)  35.64 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723565  normal  0.842062 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.23 
 
 
349 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2766  NADH dehydrogenase subunit H  30.43 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3819  NADH dehydrogenase (quinone)  31.89 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1740  NADH dehydrogenase subunit H  28.52 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0467697  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  32.17 
 
 
340 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0318  NADH dehydrogenase  33.44 
 
 
317 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.38198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  29.36 
 
 
359 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1421  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  32.24 
 
 
323 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  30.36 
 
 
345 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  30.59 
 
 
367 aa  120  3e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  33.68 
 
 
333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3697  NADH dehydrogenase subunit H  27.99 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.116468  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1867  NADH dehydrogenase subunit H  27.99 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0487349 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  33.68 
 
 
333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  33.33 
 
 
333 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0280  NADH dehydrogenase  30.47 
 
 
432 aa  119  7e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000247954 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1498  NADH dehydrogenase subunit H  30.43 
 
 
324 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1742  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.05 
 
 
318 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0161254  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  30.59 
 
 
369 aa  118  9.999999999999999e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.33 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>