More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5972 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5972  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
320 aa  618  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723565  normal  0.842062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0393  NADH dehydrogenase (quinone)  81.56 
 
 
320 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0464  NADH dehydrogenase (quinone)  81.19 
 
 
320 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0318  NADH dehydrogenase  68.04 
 
 
317 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.38198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  65.3 
 
 
322 aa  421  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000000126936  hitchhiker  0.00000000866182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0666  NADH dehydrogenase (quinone)  67.83 
 
 
317 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.471376  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4385  NADH dehydrogenase (quinone)  71.28 
 
 
322 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  48.63 
 
 
333 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  47.95 
 
 
333 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  47.95 
 
 
333 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  47.95 
 
 
333 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  47.95 
 
 
333 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  47.95 
 
 
333 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  47.95 
 
 
333 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  47.95 
 
 
333 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  47.95 
 
 
333 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  47.95 
 
 
333 aa  256  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  46.3 
 
 
333 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  47.6 
 
 
333 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  45.92 
 
 
333 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  42.58 
 
 
348 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.26 
 
 
337 aa  245  9e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  42.86 
 
 
349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  42.12 
 
 
349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.8 
 
 
349 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.3 
 
 
329 aa  239  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.06 
 
 
348 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  43.54 
 
 
322 aa  235  9e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  41.74 
 
 
462 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  40.9 
 
 
433 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  43.6 
 
 
349 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  39.94 
 
 
349 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  40.84 
 
 
341 aa  228  8e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  42.35 
 
 
438 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  41.61 
 
 
353 aa  225  8e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  41.61 
 
 
353 aa  225  9e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  41.93 
 
 
447 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  41.61 
 
 
353 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  40.51 
 
 
472 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  41.61 
 
 
451 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  42.52 
 
 
341 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  42.52 
 
 
341 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  39.52 
 
 
364 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.22 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  41.96 
 
 
330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  40.12 
 
 
430 aa  219  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1869  NADH dehydrogenase (quinone)  40.84 
 
 
372 aa  219  5e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  42.21 
 
 
372 aa  219  5e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  40.82 
 
 
372 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  40.4 
 
 
328 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  40.82 
 
 
372 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  43 
 
 
318 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.39 
 
 
331 aa  217  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  38.92 
 
 
411 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  41.77 
 
 
384 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  40.89 
 
 
372 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  40.66 
 
 
440 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  42.58 
 
 
486 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  39.93 
 
 
416 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  39.93 
 
 
416 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  39.93 
 
 
416 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0638  NADH dehydrogenase I chain H  41.21 
 
 
372 aa  215  7e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0846  NADH dehydrogenase (quinone)  39.65 
 
 
368 aa  215  9e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.637242  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  40.33 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  40.26 
 
 
372 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  41.77 
 
 
384 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  39.05 
 
 
340 aa  213  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  39.05 
 
 
340 aa  213  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  40.43 
 
 
329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  39.4 
 
 
447 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  40.24 
 
 
441 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  39 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  39.43 
 
 
372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  38.14 
 
 
410 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  40.59 
 
 
354 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  40.59 
 
 
354 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.93 
 
 
366 aa  211  9e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  41.45 
 
 
372 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  39.47 
 
 
340 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.8 
 
 
354 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40 
 
 
337 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  40.66 
 
 
351 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  39.87 
 
 
372 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0965  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.58 
 
 
372 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00465289  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.65 
 
 
344 aa  210  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  36.36 
 
 
447 aa  209  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  39.87 
 
 
372 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  39.47 
 
 
354 aa  209  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  40.81 
 
 
449 aa  209  6e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  40.19 
 
 
330 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  39.14 
 
 
340 aa  209  7e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  39.24 
 
 
372 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0375  NADH-quinone oxidoreductase, chain H  39.79 
 
 
321 aa  208  8e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  40.19 
 
 
330 aa  208  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1114  NADH dehydrogenase subunit H  40.88 
 
 
323 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  41.58 
 
 
341 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3219  NADH dehydrogenase subunit H  42.27 
 
 
337 aa  208  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.86 
 
 
349 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  38.48 
 
 
354 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.36 
 
 
343 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>