59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4789 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  100 
 
 		 710 aa  1445    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  54.07 
 
 		 701 aa  748    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  47.02 
 
 		 1011 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  49.06 
 
 		 670 aa  332  2e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  45.32 
 
 		 566 aa  308  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  41.33 
 
 		 467 aa  270  5e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  36.14 
 
 		 421 aa  231  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  34.6 
 
 		 421 aa  223  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  36.61 
 
 		 431 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  37.16 
 
 		 425 aa  221  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  36.45 
 
 		 425 aa  201  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  34.65 
 
 		 427 aa  193  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  34.76 
 
 		 459 aa  183  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  35.56 
 
 		 1031 aa  181  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  35.56 
 
 		 450 aa  177  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  32.47 
 
 		 446 aa  170  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  32.96 
 
 		 682 aa  164  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  32.75 
 
 		 770 aa  130  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  29.91 
 
 		 454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  29.47 
 
 		 772 aa  109  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  25.63 
 
 		 537 aa  100  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  25.5 
 
 		 498 aa  97.8  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  26.7 
 
 		 819 aa  97.4  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1023 aa  94.7  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  33.13 
 
 		 1332 aa  92.4  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  34.13 
 
 		 580 aa  90.5  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  34.03 
 
 		 593 aa  87.8  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  27.68 
 
 		 473 aa  87.4  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  26.55 
 
 		 924 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  26.08 
 
 		 843 aa  85.1  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  33.33 
 
 		 870 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  31.01 
 
 		 566 aa  82  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  24.86 
 
 		 551 aa  82  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  26.36 
 
 		 565 aa  80.5  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  34.22 
 
 		 570 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  26.45 
 
 		 701 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  26.59 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  31.44 
 
 		 1029 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  28.45 
 
 		 541 aa  74.7  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  27.48 
 
 		 568 aa  74.7  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  33.1 
 
 		 12684 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  27.16 
 
 		 885 aa  72  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  25.63 
 
 		 999 aa  68.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.87 
 
 		 834 aa  67  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 671 aa  65.1  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1607  hypothetical protein  32.72 
 
 		 826 aa  64.3  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0443973  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 669 aa  62.4  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.68 
 
 		 1063 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  26.85 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  27.57 
 
 		 1050 aa  57.8  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2119  hypothetical protein  37.18 
 
 		 360 aa  54.7  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.114431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 659 aa  54.7  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1913  hypothetical protein  26.59 
 
 		 215 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2228  putative PAS/PAC sensor protein  28.77 
 
 		 652 aa  50.8  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0829706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2777  hypothetical protein  39.13 
 
 		 813 aa  49.3  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  24.57 
 
 		 509 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  29.94 
 
 		 504 aa  48.5  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4330  WD40 domain-containing protein  24.77 
 
 		 518 aa  48.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  23.33 
 
 		 497 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>