More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_14740 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  100 
 
 		 515 aa  1058    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  42.97 
 
 		 499 aa  395  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  44.81 
 
 		 493 aa  383  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  40.83 
 
 		 654 aa  375  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  41.76 
 
 		 522 aa  365  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  43.12 
 
 		 593 aa  360  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  42.91 
 
 		 595 aa  359  8e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  45.83 
 
 		 583 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  43.2 
 
 		 545 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  43.2 
 
 		 541 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  42.55 
 
 		 541 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  40.69 
 
 		 588 aa  345  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  41.81 
 
 		 509 aa  330  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  38.31 
 
 		 575 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  40.35 
 
 		 455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  40.31 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  36.2 
 
 		 524 aa  284  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  35.65 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  35.65 
 
 		 441 aa  266  7e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  35.96 
 
 		 558 aa  266  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  49.41 
 
 		 258 aa  265  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  35.04 
 
 		 540 aa  258  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  35.44 
 
 		 555 aa  256  7e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  35.44 
 
 		 555 aa  256  9e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  33.15 
 
 		 543 aa  254  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  35.2 
 
 		 815 aa  251  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  32.72 
 
 		 549 aa  245  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  33.01 
 
 		 606 aa  243  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  32.55 
 
 		 601 aa  243  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  32.47 
 
 		 563 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  31.9 
 
 		 591 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  32.29 
 
 		 682 aa  240  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  33 
 
 		 538 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  32.14 
 
 		 556 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  32.44 
 
 		 545 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0549  alpha amylase catalytic region  35.48 
 
 		 537 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  31.14 
 
 		 601 aa  237  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  31.31 
 
 		 562 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  32.08 
 
 		 577 aa  236  6e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  31.49 
 
 		 567 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  32.38 
 
 		 536 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  33.21 
 
 		 553 aa  233  5e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  31.72 
 
 		 562 aa  233  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0553  alpha amylase catalytic region  34.84 
 
 		 537 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  30.37 
 
 		 1093 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  33.27 
 
 		 547 aa  232  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  30.37 
 
 		 1093 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  30.8 
 
 		 596 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  30.8 
 
 		 596 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  30.8 
 
 		 596 aa  229  9e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1251  Alpha amylase, catalytic region  30.89 
 
 		 561 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  29.82 
 
 		 560 aa  229  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  31.16 
 
 		 548 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  31.4 
 
 		 1092 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  33.2 
 
 		 647 aa  227  3e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  33 
 
 		 538 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  32.04 
 
 		 1088 aa  227  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  31.41 
 
 		 537 aa  227  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  32.02 
 
 		 564 aa  227  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  31.5 
 
 		 568 aa  227  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  32.72 
 
 		 535 aa  226  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  30.45 
 
 		 1114 aa  226  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  31.46 
 
 		 1088 aa  226  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  30.51 
 
 		 1102 aa  226  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  29.01 
 
 		 550 aa  225  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  31.46 
 
 		 1088 aa  226  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  30.53 
 
 		 1088 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  30.56 
 
 		 1088 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  31.7 
 
 		 557 aa  225  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  31.45 
 
 		 554 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  30.7 
 
 		 1102 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  30.35 
 
 		 541 aa  224  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  32.46 
 
 		 1138 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  32.76 
 
 		 561 aa  223  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  32.36 
 
 		 1136 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  30.41 
 
 		 550 aa  223  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  31.56 
 
 		 553 aa  223  8e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  31.63 
 
 		 551 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4138  alpha amylase catalytic region  32.11 
 
 		 541 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  32.76 
 
 		 561 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  32.38 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  32.57 
 
 		 1137 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  30.33 
 
 		 1102 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  33.4 
 
 		 1130 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  30.29 
 
 		 538 aa  222  9.999999999999999e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  30.67 
 
 		 1113 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  32.15 
 
 		 1137 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  32.36 
 
 		 1137 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  31.47 
 
 		 553 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  32.77 
 
 		 533 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  32.36 
 
 		 1137 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  29.15 
 
 		 1154 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  32.36 
 
 		 1137 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  30.82 
 
 		 572 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  31.15 
 
 		 529 aa  221  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0520  Alpha amylase  35.05 
 
 		 537 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  33.99 
 
 		 448 aa  221  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  31.53 
 
 		 553 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  30.31 
 
 		 549 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  30.31 
 
 		 549 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>