More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_06510 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 296 aa  598  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  44.22 
 
 		 296 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  48.63 
 
 		 299 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  48.63 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  46.96 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  46.96 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  46.95 
 
 		 307 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  50.19 
 
 		 300 aa  255  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  47.3 
 
 		 294 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  49.43 
 
 		 306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  48.28 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  46.34 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  42.32 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  46.18 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  46.34 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  44.3 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  46.34 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  47.17 
 
 		 337 aa  245  6e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  43.29 
 
 		 316 aa  245  6e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  47.29 
 
 		 297 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  45.99 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  48.66 
 
 		 294 aa  243  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  43.43 
 
 		 297 aa  242  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  44.93 
 
 		 295 aa  242  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  46.8 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  46.98 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  47.28 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  44.7 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  44.85 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  46.94 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  45.45 
 
 		 309 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  45.45 
 
 		 309 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  42.71 
 
 		 294 aa  237  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  45.63 
 
 		 309 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  43.92 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  46.31 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  45.64 
 
 		 297 aa  232  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  43.39 
 
 		 294 aa  231  9e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  45.3 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  41.67 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  47.71 
 
 		 290 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  43.61 
 
 		 295 aa  228  8e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  40.6 
 
 		 297 aa  227  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  46.82 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  49.35 
 
 		 293 aa  225  8e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  41.69 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  47.46 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  47.94 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  44.13 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  44.13 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  45.61 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  42.33 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  40.98 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  43.58 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  44.27 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  40.6 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  45.11 
 
 		 306 aa  218  7.999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  46.15 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  42.81 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  46.04 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  44.15 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  43.49 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  40.41 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  42.21 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  48 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  46.95 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  43.87 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  43.13 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  45.64 
 
 		 298 aa  215  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  40.07 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  40.2 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  40.54 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  39.24 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  42.8 
 
 		 298 aa  212  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  41.35 
 
 		 327 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  39.24 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  39.24 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  39.24 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  39.04 
 
 		 293 aa  212  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  42.86 
 
 		 299 aa  212  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  47.33 
 
 		 299 aa  211  9e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  41.52 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  40.89 
 
 		 293 aa  209  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  40.33 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  38.87 
 
 		 300 aa  208  7e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  39.44 
 
 		 291 aa  208  7e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1720  polyprenyl synthetase  41.89 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0669938  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0218  geranyltranstransferase  41.89 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  39.44 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1633  geranyltranstransferase  41.89 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0906165  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  40.97 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  38.19 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0492  geranyltranstransferase  47.57 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  43.05 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0452  geranyltranstransferase  47.57 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  42.64 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  38.21 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  38.41 
 
 		 306 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  39.58 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1719  polyprenyl synthetase  44.82 
 
 		 299 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130705  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>