More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04140 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_04140  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1036 aa  2090    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3578  UvrD/REP helicase  35.06 
 
 		 995 aa  553  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0495  UvrD/REP helicase  30.59 
 
 		 981 aa  288  5e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0736  putative recombination protein RecB  23.71 
 
 		 939 aa  146  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0910  putative recombination protein RecB  24.37 
 
 		 933 aa  142  3.9999999999999997e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.646697  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1910  UvrD/REP helicase  22.32 
 
 		 907 aa  132  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0764  UvrD/REP helicase  21.34 
 
 		 1161 aa  118  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  21.57 
 
 		 1147 aa  115  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  25.07 
 
 		 921 aa  115  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  25.45 
 
 		 915 aa  115  5e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1697  UvrD/REP helicase  22.96 
 
 		 1182 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1166  UvrD/REP helicase  24.95 
 
 		 1152 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4180  Exodeoxyribonuclease V  23.26 
 
 		 1073 aa  112  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0648836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  20.93 
 
 		 1087 aa  111  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  22.16 
 
 		 1118 aa  110  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0699  UvrD/REP helicase  28.51 
 
 		 1052 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2417  Exodeoxyribonuclease V  24.66 
 
 		 1124 aa  105  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  26.06 
 
 		 1080 aa  105  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1828  putative recombination protein RecB  25.46 
 
 		 921 aa  102  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00117116  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  26.19 
 
 		 1089 aa  102  4e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0979  UvrD/REP helicase  25.6 
 
 		 1173 aa  101  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.156033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.93 
 
 		 1139 aa  100  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  21.17 
 
 		 1101 aa  100  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1474  putative recombination protein RecB  25.32 
 
 		 921 aa  99.4  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000740501  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0252  UvrD/REP helicase  26.29 
 
 		 1060 aa  97.8  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0090  putative recombination protein RecB  23.95 
 
 		 903 aa  97.1  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1588  ATP-dependent DNA helicase UvrD  21.49 
 
 		 1067 aa  96.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0973  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.01 
 
 		 1155 aa  95.9  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117254 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1654  putative recombination protein RecB  25.14 
 
 		 921 aa  95.9  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1433  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.8 
 
 		 1199 aa  95.5  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0691  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.43 
 
 		 1200 aa  94  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0723  UvrD/REP helicase  21.38 
 
 		 1196 aa  94  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  21.47 
 
 		 1149 aa  92.8  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  21.03 
 
 		 1182 aa  92.4  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  21.48 
 
 		 1197 aa  92  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  24.6 
 
 		 854 aa  92  5e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.14 
 
 		 1207 aa  91.7  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3814  exonuclease V subunit beta  24.16 
 
 		 1183 aa  91.3  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.0108471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.87 
 
 		 1200 aa  90.9  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  20.86 
 
 		 1155 aa  90.9  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  23.33 
 
 		 1207 aa  90.1  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  24.03 
 
 		 795 aa  90.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  24.13 
 
 		 795 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0011  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.85 
 
 		 1241 aa  89.4  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  25.58 
 
 		 1110 aa  89.4  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2025  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.7 
 
 		 1224 aa  88.6  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  23.21 
 
 		 798 aa  87.8  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  23.32 
 
 		 1146 aa  87.4  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3206  UvrD/REP helicase  21.09 
 
 		 1290 aa  87.4  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3118  UvrD/REP helicase  23.35 
 
 		 1061 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674969 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  25.16 
 
 		 1110 aa  86.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3389  exonuclease V subunit beta  24.24 
 
 		 1203 aa  86.3  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  23.82 
 
 		 1392 aa  85.5  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  22.82 
 
 		 797 aa  85.9  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1797  Exodeoxyribonuclease V  25.24 
 
 		 1120 aa  85.1  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00119316  normal  0.701381 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0914  hypothetical protein  25.2 
 
 		 913 aa  85.1  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.230756 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.31 
 
 		 1186 aa  84.7  0.000000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0344  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.02 
 
 		 1130 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  21.97 
 
 		 1095 aa  84  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1774  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.07 
 
 		 1274 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  22.68 
 
 		 1101 aa  84.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  23.58 
 
 		 1244 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2148  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.03 
 
 		 1259 aa  84  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03180  putative helicase  25.84 
 
 		 1054 aa  83.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.927265  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12091  UvrD/REP helicase subunit B  24.57 
 
 		 1208 aa  83.2  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.97 
 
 		 1223 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  22.74 
 
 		 1168 aa  82.4  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3622  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.51 
 
 		 1135 aa  82  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0324  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.27 
 
 		 1129 aa  82  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.904758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2246  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.18 
 
 		 1263 aa  82  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1777  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.39 
 
 		 1272 aa  81.6  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000848552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2642  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.64 
 
 		 1229 aa  81.6  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  22.14 
 
 		 1121 aa  81.6  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12101  UvrD/REP helicase subunit B  24.58 
 
 		 1208 aa  80.5  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  23.85 
 
 		 1184 aa  80.5  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1160  UvrD/REP helicase  22.76 
 
 		 1064 aa  80.5  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.737588 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2360  UvrD/REP helicase  23.41 
 
 		 816 aa  80.9  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2400  UvrD/REP helicase  22.53 
 
 		 1194 aa  81.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.29 
 
 		 1203 aa  80.9  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.01 
 
 		 1208 aa  80.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0953517  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  25.68 
 
 		 1282 aa  80.1  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.95 
 
 		 860 aa  80.5  0.0000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  21.66 
 
 		 1161 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1852  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.02 
 
 		 1269 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0914  exonuclease V subunit beta  24.15 
 
 		 1194 aa  79.7  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  22.2 
 
 		 705 aa  79.7  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.21 
 
 		 1156 aa  80.1  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  23.03 
 
 		 816 aa  79.7  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  20.97 
 
 		 1140 aa  80.5  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  23.59 
 
 		 1180 aa  79.7  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  25.79 
 
 		 1121 aa  79.7  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1055  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.67 
 
 		 1203 aa  79  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2023  UvrD/REP helicase  25.27 
 
 		 845 aa  79.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.184337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  23.68 
 
 		 816 aa  79  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  19.98 
 
 		 1107 aa  78.6  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0644  UvrD/REP helicase  22.34 
 
 		 1109 aa  78.6  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2420  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.05 
 
 		 1238 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415139  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  24.27 
 
 		 1217 aa  78.2  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1084  UvrD/REP helicase  24.87 
 
 		 789 aa  78.2  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2193  UvrD/REP helicase  21.41 
 
 		 1103 aa  78.2  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>