More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6020 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  100 
 
 
1666 aa  3360    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.83 
 
 
1131 aa  179  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  26.34 
 
 
1774 aa  178  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1401  serine/threonine protein kinase  27.85 
 
 
1333 aa  157  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  19.35 
 
 
1826 aa  156  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
906 aa  155  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.28 
 
 
1403 aa  155  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 
947 aa  151  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.73 
 
 
1808 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  22.55 
 
 
1932 aa  151  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  22.71 
 
 
1805 aa  149  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 
962 aa  145  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
792 aa  146  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.92 
 
 
1845 aa  145  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.6 
 
 
627 aa  144  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  28.53 
 
 
1833 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
919 aa  143  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  22.6 
 
 
1908 aa  142  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  28 
 
 
1885 aa  142  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  36 
 
 
557 aa  140  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
625 aa  140  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  34.57 
 
 
927 aa  140  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4074  serine/threonine protein kinase  29.15 
 
 
1297 aa  139  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0173368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 
556 aa  138  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  23.62 
 
 
2279 aa  138  8e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  29.68 
 
 
560 aa  138  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  27.9 
 
 
2051 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 
587 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  23.65 
 
 
2303 aa  137  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
920 aa  137  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  26.08 
 
 
1922 aa  137  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  33.99 
 
 
678 aa  137  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
579 aa  136  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2939  serine/threonine protein kinase  37.6 
 
 
445 aa  135  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
875 aa  135  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
614 aa  135  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
873 aa  135  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 
1271 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1246  histidine kinase  31.13 
 
 
762 aa  134  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124717  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 
882 aa  134  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
556 aa  134  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.12815  normal  0.758765 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  34.22 
 
 
683 aa  134  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  33.9 
 
 
651 aa  134  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  26.32 
 
 
1809 aa  134  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.2 
 
 
658 aa  134  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4114  serine/threonine protein kinase  32.96 
 
 
513 aa  134  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.0166963 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 
1548 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
639 aa  132  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  33.21 
 
 
1346 aa  132  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.3 
 
 
1287 aa  132  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 
1391 aa  132  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  35.11 
 
 
692 aa  132  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3400  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.2 
 
 
1373 aa  130  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.32 
 
 
667 aa  131  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  34.41 
 
 
707 aa  131  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
593 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
932 aa  130  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1308  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
894 aa  130  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.455977  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
2153 aa  130  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  33.84 
 
 
1435 aa  130  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  32.94 
 
 
727 aa  130  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
1060 aa  130  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2941  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 
696 aa  129  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.843677  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 
1207 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
945 aa  129  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  31.73 
 
 
1122 aa  129  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.44 
 
 
2017 aa  129  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  37.6 
 
 
468 aa  129  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
701 aa  129  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  31.58 
 
 
662 aa  129  5e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
1125 aa  129  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  26.51 
 
 
1685 aa  128  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.07 
 
 
652 aa  128  8.000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.25 
 
 
696 aa  128  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 
647 aa  128  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
641 aa  128  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  33.58 
 
 
1125 aa  127  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.95 
 
 
662 aa  127  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
613 aa  127  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
718 aa  127  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 
596 aa  127  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.05 
 
 
1804 aa  127  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  33.99 
 
 
613 aa  127  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
519 aa  127  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1445  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 
576 aa  127  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0452635  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35 
 
 
642 aa  127  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
639 aa  127  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  27.48 
 
 
1837 aa  126  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.5 
 
 
1805 aa  127  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.9 
 
 
1942 aa  126  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.03 
 
 
1780 aa  126  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1005  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
646 aa  126  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442988  decreased coverage  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 
2161 aa  126  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  26.13 
 
 
1685 aa  126  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
601 aa  126  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
612 aa  126  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.81 
 
 
1184 aa  125  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
601 aa  125  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.21 
 
 
641 aa  125  6e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
458 aa  125  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>