More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1445 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1445  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
576 aa  1168    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0452635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
695 aa  163  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
718 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1701  PAS sensor protein  38.1 
 
 
975 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454558  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 
701 aa  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
815 aa  144  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
1171 aa  143  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
418 aa  140  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
933 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
585 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
546 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  35.39 
 
 
617 aa  136  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
880 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
639 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  33.73 
 
 
473 aa  134  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
534 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
884 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 
882 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
1131 aa  134  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
725 aa  134  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  30.61 
 
 
713 aa  133  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
597 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
473 aa  133  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  32.22 
 
 
461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 
1287 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  29.69 
 
 
539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  32.22 
 
 
461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
827 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
733 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  32.64 
 
 
461 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  32.06 
 
 
993 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
623 aa  131  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
639 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  32.36 
 
 
582 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
621 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
639 aa  130  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 
1391 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
412 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
582 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
609 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2634  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0932991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
608 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
466 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  32.22 
 
 
464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
641 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.82 
 
 
745 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
585 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
1048 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  31.8 
 
 
1003 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
587 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
593 aa  127  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
464 aa  127  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2720  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
407 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
906 aa  127  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  32.92 
 
 
527 aa  126  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
587 aa  127  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  33.2 
 
 
587 aa  126  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  33.6 
 
 
587 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  33.6 
 
 
587 aa  126  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  30.28 
 
 
470 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  33.6 
 
 
587 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  33.6 
 
 
587 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2230  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 
707 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129446  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  33.6 
 
 
587 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  32 
 
 
470 aa  126  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
640 aa  126  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  33.6 
 
 
587 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  33.6 
 
 
587 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
1060 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  33.6 
 
 
587 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
726 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.62189  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
875 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
473 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  32.82 
 
 
745 aa  125  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
637 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  34.98 
 
 
449 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
597 aa  125  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
905 aa  125  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
590 aa  124  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
457 aa  124  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.93 
 
 
1666 aa  124  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
621 aa  124  6e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
566 aa  124  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
511 aa  124  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  31 
 
 
511 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  35.12 
 
 
537 aa  123  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
514 aa  123  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108097  normal  0.083954 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
620 aa  123  9e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  33.47 
 
 
581 aa  123  9e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0290  histidine kinase  34.43 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  31.28 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  29.89 
 
 
908 aa  123  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1842  histidine kinase  28.78 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
581 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
911 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0472  hypothetical protein  31.03 
 
 
252 aa  122  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
600 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>