More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2465 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2465  endonuclease III  100 
 
 		 220 aa  450  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.341333 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  63.72 
 
 		 217 aa  281  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  64.59 
 
 		 217 aa  279  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02735  Endonuclease III/Nth  59.91 
 
 		 237 aa  274  6e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  60.7 
 
 		 227 aa  272  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2438  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  56.42 
 
 		 218 aa  259  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00334229  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17641  putative endonuclease  59.81 
 
 		 217 aa  258  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09263  endonuclease III/Nth  54.59 
 
 		 218 aa  256  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208041  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  59.53 
 
 		 216 aa  251  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1412  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  62.8 
 
 		 231 aa  251  7e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08631  putative endonuclease  56.22 
 
 		 217 aa  248  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0810  putative endonuclease  56.72 
 
 		 217 aa  248  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08661  putative endonuclease  56.22 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07791  putative endonuclease  52.15 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2158  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  57.81 
 
 		 209 aa  245  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08421  putative endonuclease  51.66 
 
 		 217 aa  244  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  hitchhiker  0.00457853 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0210  putative endonuclease  52.13 
 
 		 217 aa  244  6e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0549  endonuclease III  58.71 
 
 		 212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0850765 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09581  putative endonuclease  50.7 
 
 		 217 aa  225  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.136749  hitchhiker  0.00149205 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.15 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  42.21 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  44.95 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  43.28 
 
 		 219 aa  171  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  43.28 
 
 		 219 aa  171  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  43.28 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  45.55 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  44.95 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  46.19 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  49.74 
 
 		 239 aa  168  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0069  endonuclease III  46.15 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  46.89 
 
 		 197 aa  168  5e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  42.93 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  42.93 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  47.34 
 
 		 246 aa  167  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  43.98 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  42.93 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  43.65 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  46.88 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  43.75 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  44.62 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.67 
 
 		 237 aa  165  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.93 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2500  endonuclease III  48.64 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666144  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  45.54 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  42.93 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  42.93 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  42.93 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  42.93 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  43.65 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  42.93 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  42.93 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  47.5 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  42.93 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  43.9 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.92 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1491  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.38 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021977  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  41.46 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  44.51 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  40.91 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  44.61 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  43.65 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  43.65 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  43.62 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  43.65 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  43.65 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  43.65 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  43.65 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  47.5 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  48.66 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  43.65 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  43.41 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  43.96 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  43.9 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  42.29 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1838  endonuclease III  45.96 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.749072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  38.46 
 
 		 209 aa  158  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  41.09 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  37.98 
 
 		 209 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  39.59 
 
 		 286 aa  158  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0561  endonuclease III  48 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.1956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.36 
 
 		 243 aa  157  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  45.69 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  43.37 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  47.64 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  43.65 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.41 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1772  endonuclease III  40.58 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  44 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  39.11 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.12 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  40.81 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  42.93 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0597  endonuclease III  48 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  47.5 
 
 		 270 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  43.37 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  45.64 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  41.18 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.26 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  42.08 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>