293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2308 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 284 aa  569  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  41.43 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  40.36 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  46.85 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  39.64 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  39.08 
 
 		 283 aa  208  8e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  40.36 
 
 		 283 aa  205  9e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  41.6 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  41.18 
 
 		 283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  41.67 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  34.33 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  38.54 
 
 		 325 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  38.25 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  36.23 
 
 		 660 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  32.51 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  32.68 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  31.08 
 
 		 325 aa  128  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  35.57 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  32.2 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  36.84 
 
 		 313 aa  125  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  28.74 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  34.01 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  33.33 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  35.03 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  33.78 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  33.78 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  36.41 
 
 		 321 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  33.51 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  33.83 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  32.16 
 
 		 316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  33.15 
 
 		 535 aa  119  3.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  36.61 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  35.44 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  34.62 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  33.52 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  34.34 
 
 		 325 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  37.21 
 
 		 320 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  35.83 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  33.51 
 
 		 330 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  34.15 
 
 		 325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  31.55 
 
 		 321 aa  116  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  31.77 
 
 		 309 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  30.59 
 
 		 325 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  37.04 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 332 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  35.57 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  32.56 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  34.69 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  35.37 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  36.99 
 
 		 322 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  38.15 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  32.14 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  31.68 
 
 		 310 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  32.79 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  37.5 
 
 		 326 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  30.19 
 
 		 310 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  28.57 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  30.66 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  35.33 
 
 		 320 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  31.4 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  34.73 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  27.85 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  33.33 
 
 		 310 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  30 
 
 		 322 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  31.43 
 
 		 322 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  27.86 
 
 		 323 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  27.31 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  30.16 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  30.2 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  31.71 
 
 		 323 aa  99  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  30.67 
 
 		 322 aa  98.6  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  30.67 
 
 		 322 aa  98.6  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  31.46 
 
 		 322 aa  99  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  32.96 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  31.71 
 
 		 323 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  34.72 
 
 		 316 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  29.95 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  31.03 
 
 		 322 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2020  type II secretion system protein  33.73 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243296  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  29.06 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  27.91 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  27.8 
 
 		 324 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  33.54 
 
 		 314 aa  92  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  29.35 
 
 		 324 aa  92  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  31.52 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  26 
 
 		 334 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  28.02 
 
 		 336 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  27.37 
 
 		 324 aa  89.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1755  type II secretion system protein  29.24 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0468876  normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2046  type II secretion system protein  32.16 
 
 		 325 aa  89.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 324 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  27.06 
 
 		 328 aa  89.4  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  26.84 
 
 		 324 aa  89  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  30.99 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  24.21 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>