131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3262 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 
442 aa  866    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  35.97 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  35.57 
 
 
389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  33.77 
 
 
393 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  36.63 
 
 
406 aa  209  8e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  34.4 
 
 
413 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  33.33 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  32.82 
 
 
411 aa  201  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  38.46 
 
 
413 aa  173  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  33.78 
 
 
408 aa  170  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  35.5 
 
 
408 aa  158  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  36.36 
 
 
414 aa  141  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  26.52 
 
 
387 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  26.88 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  27.1 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  25.37 
 
 
387 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  27.68 
 
 
385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  26.78 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  26.96 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  27.74 
 
 
383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  26.44 
 
 
385 aa  109  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  26.42 
 
 
387 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  26.2 
 
 
383 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  25.49 
 
 
389 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  30.3 
 
 
386 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  24.41 
 
 
417 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  25.06 
 
 
389 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  25.97 
 
 
456 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  23.86 
 
 
416 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  26 
 
 
385 aa  100  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  27.22 
 
 
453 aa  99.8  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  27.33 
 
 
400 aa  97.1  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  30.16 
 
 
430 aa  96.3  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  26.26 
 
 
414 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  23.6 
 
 
416 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  25.06 
 
 
397 aa  94  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  23.95 
 
 
416 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  30.8 
 
 
448 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  28.41 
 
 
624 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  26.05 
 
 
386 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  26.3 
 
 
469 aa  90.1  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  29.08 
 
 
391 aa  90.1  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3088  polysulphide reductase, NrfD  30.1 
 
 
414 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.187838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3188  Polysulphide reductase NrfD  29.49 
 
 
413 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0920163  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3282  Polysulphide reductase NrfD  29.49 
 
 
413 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  24.56 
 
 
472 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  27.92 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  30.25 
 
 
483 aa  83.6  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3196  Polysulphide reductase NrfD  25.62 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  26.42 
 
 
425 aa  82  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  26.56 
 
 
624 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3520  polysulphide reductase, NrfD  25.61 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000358671  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1066  Polysulphide reductase NrfD  26.17 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4681800000000002e-26 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  25 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0864  polysulphide reductase, NrfD  23.62 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0258189  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  26.27 
 
 
484 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2474  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  25.13 
 
 
400 aa  77  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.750101  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  25.72 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2935  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  25.41 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.52066  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  23.48 
 
 
468 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  25.36 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  27.63 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  25.79 
 
 
482 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3393  Polysulphide reductase NrfD  24.64 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  27.34 
 
 
454 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0327  polysulphide reductase, NrfD  24.51 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.180424  hitchhiker  0.00000238958 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  26.33 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5823  polysulphide reductase NrfD  27.51 
 
 
451 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  25.3 
 
 
472 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  30.21 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  25.71 
 
 
593 aa  70.5  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0070  oxidoreductase, membrane subunit  26.05 
 
 
417 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.386248  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  25.11 
 
 
466 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  24.37 
 
 
466 aa  69.7  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  23.19 
 
 
478 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  23.19 
 
 
478 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  25.58 
 
 
477 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  23.17 
 
 
478 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  25.87 
 
 
603 aa  68.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  26.79 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  26.32 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  27 
 
 
490 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  24.02 
 
 
454 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  25.1 
 
 
451 aa  66.6  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  26.32 
 
 
393 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  24.37 
 
 
494 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0048  polysulfide reductase, subunit C, putative  24.58 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.939472 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  26.43 
 
 
445 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0161  Polysulphide reductase NrfD  23.26 
 
 
456 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.116185  normal  0.0186835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  27.07 
 
 
476 aa  63.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  21.51 
 
 
493 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0217  polysulphide reductase NrfD  23.26 
 
 
456 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0019  Polysulphide reductase NrfD  23.46 
 
 
461 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0465805  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6224  polysulphide reductase NrfD  26.14 
 
 
452 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.468999  normal  0.0125183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0608  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  25.66 
 
 
417 aa  60.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0543645  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  23.16 
 
 
402 aa  60.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  25.12 
 
 
417 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  27.07 
 
 
361 aa  59.7  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  26.48 
 
 
463 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  23.36 
 
 
471 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>