288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1890 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 414 aa  815    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.43 
 
 		 396 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.89 
 
 		 431 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 		 440 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4702  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 397 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29660  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.49 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  22.97 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  22.66 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  23.13 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10200  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.82 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0158104  normal  0.0492855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3634  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135402  normal  0.0306752 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  28.5 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  24.94 
 
 		 1106 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  27.97 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  24.23 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  24.15 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1062  ABC-2 type transporter  23.95 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  25.99 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3747  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3153  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0057  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  26.94 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  22.17 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3438  ABC-2 type transporter  24.33 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0748672 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  23.96 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  22.57 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5801  ABC-2 type transporter  23.04 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552117  normal  0.846192 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3970  hypothetical protein  23.19 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 380 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0216  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 		 257 aa  66.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.692272 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  23.82 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  22.68 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  23.72 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  22.03 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  21.86 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  25.58 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  23.57 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  22.33 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  23.4 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0715  hypothetical protein  25.31 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  21.79 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  21.79 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0697  hypothetical protein  25.06 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  25.06 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5035  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.37 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  22.52 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  24.94 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  21.87 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  24.1 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4131  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  24.08 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  23.49 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  23.71 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  28.18 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  23.19 
 
 		 370 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  21.56 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  23.51 
 
 		 383 aa  59.7  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4677  ABC-2 type transporter  22.6 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.521717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  23.27 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  23.13 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  24.08 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  23.22 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1411  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  25.06 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  22.11 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  23.49 
 
 		 901 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  24.69 
 
 		 427 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3535  ABC transporter, permease protein  21.1 
 
 		 369 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  22.57 
 
 		 378 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 368 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  23.38 
 
 		 928 aa  57  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1866  ABC transporter, permease protein  21.45 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181745  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  23.82 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  27.62 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1640  multidrug ABC transporter, permease  19.88 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000347744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  27.62 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  21.7 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1916  ABC transporter, permease protein  21.45 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  22.35 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1659  ABC-2 type transporter  21.7 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0599997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>