More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1555 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  58.77 
 
 		 230 aa  254  5e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  48.9 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  45.41 
 
 		 242 aa  208  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  44.3 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  48.67 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  44.93 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  46.8 
 
 		 231 aa  201  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  45.13 
 
 		 234 aa  201  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  43.86 
 
 		 230 aa  201  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  46.46 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  48.46 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  44.29 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  46.46 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  39.36 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  43.42 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  45.97 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  47.56 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  46.45 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  43.5 
 
 		 225 aa  187  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  40.91 
 
 		 237 aa  187  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  44.35 
 
 		 231 aa  187  9e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  40.53 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  44.14 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  44.3 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  41.27 
 
 		 253 aa  185  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  42.73 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  42.22 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  38.46 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  42.15 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  42.29 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  42.98 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  41.41 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  44.14 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  44 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  44.84 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  45.41 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  44.84 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  42.92 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  37.12 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  41.07 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  44.93 
 
 		 228 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  46.09 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  40.61 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  41.92 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  41.78 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  48.78 
 
 		 202 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  43.96 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  44.2 
 
 		 229 aa  175  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  41.41 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  44.5 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  45.02 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  38.77 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  38.1 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  41.15 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  40.53 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  39.19 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  41.89 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  41.38 
 
 		 232 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  42.36 
 
 		 257 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  41.26 
 
 		 262 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  40.81 
 
 		 271 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  42.31 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3702  alanine racemase domain protein  45.32 
 
 		 237 aa  170  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  41.85 
 
 		 246 aa  170  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  42.54 
 
 		 275 aa  169  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  39.29 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  42.11 
 
 		 236 aa  169  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  43.86 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  38.33 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  39.56 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  38.96 
 
 		 236 aa  168  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  42.41 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  43.48 
 
 		 241 aa  168  7e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  41.48 
 
 		 237 aa  168  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  38.67 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  38.01 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  43.6 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  40.89 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  38.6 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  37.44 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  41.63 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  40.53 
 
 		 229 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  40.69 
 
 		 233 aa  164  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  39.74 
 
 		 232 aa  164  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  38.43 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  40.89 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  40.44 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  37.99 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  39.91 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  38.57 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  38.43 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  47.06 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  39.64 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  40.72 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  43.42 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  36.77 
 
 		 280 aa  162  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  38.43 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  44.64 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>