173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5073 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 205 aa  403  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  60.77 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  54.85 
 
 		 212 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  60.56 
 
 		 229 aa  207  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  60.56 
 
 		 213 aa  207  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  64.64 
 
 		 211 aa  200  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  60.39 
 
 		 212 aa  199  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  55 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  52.28 
 
 		 227 aa  188  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  58.48 
 
 		 199 aa  188  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  52.6 
 
 		 213 aa  187  9e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  58.89 
 
 		 272 aa  185  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  56.5 
 
 		 249 aa  181  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  53.59 
 
 		 212 aa  180  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  49.25 
 
 		 202 aa  174  8e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  60.56 
 
 		 181 aa  171  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  57.78 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  53.2 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  49.03 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  54.44 
 
 		 181 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  54.44 
 
 		 180 aa  155  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  52.28 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 181 aa  141  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 181 aa  141  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 181 aa  141  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  46.11 
 
 		 198 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  50.53 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 187 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  31.43 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  35.34 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  37.37 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  54.55 
 
 		 183 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  34.19 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  23.03 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 372 aa  58.9  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  24.16 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  29.49 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  28.06 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  49.12 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  22.47 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 183 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  21.55 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  21.55 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  21.55 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  21.55 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  21.55 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  29.41 
 
 		 179 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  28.09 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 176 aa  52  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  35.94 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  35.23 
 
 		 107 aa  51.2  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  34.69 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  27.98 
 
 		 175 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 127 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  35.94 
 
 		 175 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  49.3  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 168 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  37.21 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  49.02 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  40.38 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  29.23 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2808  PadR-like family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 175 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  25.93 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  35.21 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  47.92 
 
 		 277 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  34.67 
 
 		 277 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  28.89 
 
 		 112 aa  46.2  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  29.52 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  32.26 
 
 		 107 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  32.26 
 
 		 107 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 108 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  31.03 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  37.04 
 
 		 116 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  42.31 
 
 		 316 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  41.38 
 
 		 110 aa  44.7  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  27.72 
 
 		 180 aa  44.7  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  41.18 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  47.92 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 159 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  40.35 
 
 		 334 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  26.39 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  38.6 
 
 		 150 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  30.88 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  30.43 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>