More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0688 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  100 
 
 		 383 aa  759    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  41.67 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  41.54 
 
 		 388 aa  202  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0487  Peptidase M23  35.34 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  40.48 
 
 		 378 aa  180  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.41 
 
 		 554 aa  172  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.88 
 
 		 547 aa  172  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  34.31 
 
 		 349 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  33.78 
 
 		 348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  46.38 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  46.34 
 
 		 271 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  45.99 
 
 		 233 aa  124  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  53.15 
 
 		 229 aa  123  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  50.36 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  51.88 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  46.72 
 
 		 406 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  47.06 
 
 		 360 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  47.06 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  47.06 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  40 
 
 		 375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  47.83 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  43.17 
 
 		 236 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  46.38 
 
 		 334 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  45.39 
 
 		 231 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  48.46 
 
 		 445 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  47.92 
 
 		 270 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  46.72 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  46.15 
 
 		 269 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  46.48 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  46.03 
 
 		 491 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  47.76 
 
 		 320 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  45.07 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  50 
 
 		 238 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  47.66 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  46.62 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  46.1 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2128  hypothetical protein  44.97 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  hitchhiker  0.00659313 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1354  peptidase M23B  41.55 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000810467  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  48.18 
 
 		 243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  45.38 
 
 		 468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  46.81 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  45.86 
 
 		 251 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  43.26 
 
 		 458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  46.81 
 
 		 238 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.44 
 
 		 326 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  44.36 
 
 		 446 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  38.78 
 
 		 402 aa  109  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1314  cell wall endopeptidase  41.84 
 
 		 423 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1313  cell wall endopeptidase  41.84 
 
 		 423 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  47.65 
 
 		 415 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1339  M24/M37 family peptidase  41.84 
 
 		 417 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1449  M23/37 family peptidase  41.84 
 
 		 417 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000128519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1523  peptidase, M23/M37 family  41.84 
 
 		 423 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.25649e-59 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1554  M24/M37 family peptidase  41.84 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000152765  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  41.79 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  38.37 
 
 		 482 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1592  peptidase, M23/M37 family  41.84 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  41.79 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  45.89 
 
 		 751 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1152  peptidase M23B  41.84 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000291008  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  42.96 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  42.66 
 
 		 198 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  45.86 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  43.36 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  43.08 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  45.86 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  40.94 
 
 		 302 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  44.93 
 
 		 454 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  41.96 
 
 		 198 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  46.1 
 
 		 283 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  42.34 
 
 		 272 aa  106  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  33.63 
 
 		 402 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  46.62 
 
 		 339 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1486  cell wall endopeptidase, family M23/M37  40.43 
 
 		 421 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  40.43 
 
 		 424 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2275  hypothetical protein  45.26 
 
 		 282 aa  106  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329742  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4302  hypothetical protein  35.78 
 
 		 305 aa  106  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.628164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  32.42 
 
 		 455 aa  105  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  40.8 
 
 		 590 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  45.59 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0072  hypothetical protein  38.12 
 
 		 200 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.736738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  43.07 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  41.61 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  41.61 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4522  hypothetical protein  42.25 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.594874 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  42.14 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  42.11 
 
 		 824 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  44.53 
 
 		 448 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  44.2 
 
 		 457 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  44.97 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2417  hypothetical protein  38.12 
 
 		 194 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0954159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  44.2 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  36.71 
 
 		 325 aa  103  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  46.85 
 
 		 324 aa  103  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  43.28 
 
 		 582 aa  102  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  41.3 
 
 		 224 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  42.76 
 
 		 727 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  43.41 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2996  hypothetical protein  37.5 
 
 		 194 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  44.2 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>