More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3466 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  100 
 
 		 162 aa  320  4e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  48.7 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  43.33 
 
 		 115 aa  91.3  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  37.69 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0240  Camphor resistance CrcB protein  52.53 
 
 		 178 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  40.16 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0191  Camphor resistance CrcB protein  43.51 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0375679  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  39.37 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  42.37 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  36.36 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  41.67 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  38.33 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  38.71 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  31.67 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  41.88 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  34.35 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  34.15 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  31.45 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18960  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  38.02 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  34.71 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  32.7 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  35.65 
 
 		 123 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 118 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  39.84 
 
 		 270 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0925  Camphor resistance CrcB protein  56.25 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.44689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  40 
 
 		 120 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  42.45 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  38.06 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5763  Camphor resistance CrcB protein  38.32 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  32.88 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3281  Camphor resistance CrcB protein  41.09 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  34.85 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  38.3 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  32.76 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1305  camphor resistance protein CrcB  34.4 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  34.65 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  35.34 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  32.23 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  41.23 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0845  Integral membrane protein for chromosome condensation  32.41 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1467  camphor resistance protein CrcB  34.4 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  34.88 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  31.54 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  38.17 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  32 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  29.32 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  35.2 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  34.59 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  34.17 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  29.33 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  37.29 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  36.08 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  34.09 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  29.32 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  36.45 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  35.09 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  35.43 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  35.51 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  32.23 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  33.86 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  36.43 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1311  CrcB protein  44.59 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  33.62 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  33.86 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  32.48 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  31.78 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  30.6 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1727  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  32.43 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1774  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0528824  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>