208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18960 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_18960  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
171 aa  324  4.0000000000000003e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  44.3 
 
 
162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  43.85 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  39.33 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  40.5 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  45.53 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0240  Camphor resistance CrcB protein  46.67 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  41.46 
 
 
131 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  41.74 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  39.34 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  35.04 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  43.18 
 
 
140 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  40.78 
 
 
131 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  38.69 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  37.01 
 
 
129 aa  61.6  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0191  Camphor resistance CrcB protein  46.43 
 
 
159 aa  61.6  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0375679  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 
132 aa  60.8  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  37.3 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  33.61 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  34.38 
 
 
128 aa  59.3  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  36.89 
 
 
124 aa  58.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  36.61 
 
 
166 aa  58.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  35.71 
 
 
155 aa  58.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  43.68 
 
 
124 aa  58.2  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 
124 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1305  camphor resistance protein CrcB  36.29 
 
 
127 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  35.2 
 
 
130 aa  57.4  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3281  Camphor resistance CrcB protein  52.42 
 
 
152 aa  57.4  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  38.21 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1467  camphor resistance protein CrcB  36.29 
 
 
127 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  40.22 
 
 
129 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  34.38 
 
 
124 aa  57  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  33.91 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  38.53 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 
129 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1311  CrcB protein  50.75 
 
 
127 aa  55.1  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  29.01 
 
 
132 aa  55.5  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  39.5 
 
 
126 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  32.81 
 
 
124 aa  55.5  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 
125 aa  55.1  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  36.89 
 
 
131 aa  54.7  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  26.4 
 
 
134 aa  54.3  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 
118 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  36.29 
 
 
127 aa  54.3  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  26.4 
 
 
134 aa  54.3  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  26.4 
 
 
134 aa  54.3  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2721  Camphor resistance CrcB protein  27.07 
 
 
139 aa  54.3  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.186875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 
128 aa  54.3  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 
118 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 
140 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  38.21 
 
 
124 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  31.87 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 
118 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5116  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  34.92 
 
 
125 aa  53.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  34.17 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0457  Camphor resistance CrcB protein  39.06 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.973479  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  31.87 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1326  crcB protein  39.08 
 
 
129 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  40.24 
 
 
125 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  38.37 
 
 
124 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  31.45 
 
 
118 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  31.45 
 
 
118 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  37.21 
 
 
124 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 
118 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  33.33 
 
 
118 aa  51.6  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 
129 aa  51.6  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  37.89 
 
 
132 aa  51.6  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  36.36 
 
 
128 aa  51.6  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3965  Camphor resistance CrcB protein  36.52 
 
 
179 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00934681  normal  0.343855 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  31.45 
 
 
118 aa  51.2  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  39.08 
 
 
120 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  31.93 
 
 
126 aa  51.2  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  31.3 
 
 
134 aa  51.2  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  36.07 
 
 
133 aa  51.2  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  34.52 
 
 
124 aa  51.2  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  27.21 
 
 
134 aa  50.8  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  35.43 
 
 
152 aa  50.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  30.95 
 
 
120 aa  50.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  38.82 
 
 
124 aa  50.8  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1306  CrcB protein  33.9 
 
 
127 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1468  CrcB protein  33.9 
 
 
127 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  31.45 
 
 
118 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1370  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
129 aa  50.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  34.33 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0845  Integral membrane protein for chromosome condensation  33.33 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  35.29 
 
 
228 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5115  Camphor resistance CrcB protein  33.9 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  36.63 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 
128 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  36.05 
 
 
125 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7365  Camphor resistance CrcB protein  38.82 
 
 
97 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  33.68 
 
 
125 aa  50.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  38.82 
 
 
124 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
124 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  36.29 
 
 
131 aa  49.3  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  35.29 
 
 
124 aa  48.9  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  28.09 
 
 
123 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>