126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2203 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  100 
 
 		 363 aa  757    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  37.98 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  35.64 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  35.54 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  35.79 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  36.89 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  36.94 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  36.07 
 
 		 299 aa  176  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  33.88 
 
 		 317 aa  173  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  31.27 
 
 		 333 aa  167  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  32.92 
 
 		 318 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  32.67 
 
 		 334 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  30.52 
 
 		 315 aa  166  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  33.44 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  31.71 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  31.73 
 
 		 329 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  31.73 
 
 		 329 aa  162  9e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  31.73 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  30.14 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  30.14 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  30.14 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  33.12 
 
 		 540 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  33.57 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  35.13 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  29.86 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  31.12 
 
 		 333 aa  159  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  37.15 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  30.79 
 
 		 333 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  31.1 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  35.66 
 
 		 315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  31.95 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  31.53 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  32.48 
 
 		 577 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  37.07 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  32.33 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  31.83 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  32.21 
 
 		 329 aa  152  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  31.53 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  30.66 
 
 		 315 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  31.53 
 
 		 319 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  36.53 
 
 		 307 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  34.52 
 
 		 316 aa  149  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  32.2 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  30.09 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  32.38 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  31.75 
 
 		 322 aa  143  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  30.94 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  30.06 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  29.76 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  30.15 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  29.17 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  31.63 
 
 		 304 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  29.33 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  29.33 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  29.46 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  30.15 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  31.93 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  30 
 
 		 259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  30.03 
 
 		 286 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  29.6 
 
 		 287 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  32.22 
 
 		 646 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  30.99 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  29.79 
 
 		 658 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  29.84 
 
 		 658 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  29.97 
 
 		 480 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  30.77 
 
 		 658 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  37.4 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  32.65 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  35.11 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3114  cytochrome C family protein  33.74 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  33.12 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  28.51 
 
 		 650 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  33.14 
 
 		 650 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  27.14 
 
 		 656 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  28.07 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  27.16 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  29.15 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  25.28 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  26.89 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  24.51 
 
 		 436 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  28.57 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  24.12 
 
 		 436 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  24.12 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  24.53 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3839  cytochrome C family protein  34.35 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  29.21 
 
 		 358 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  28.71 
 
 		 384 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  30.34 
 
 		 154 aa  53.1  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  26.48 
 
 		 768 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  28.71 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0616  cytochrome c family protein  29.01 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  29.58 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  26.81 
 
 		 154 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  30.97 
 
 		 153 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2757  cytochrome C family protein  35.04 
 
 		 201 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 537 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  25.94 
 
 		 616 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 654 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  27.94 
 
 		 757 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  26.36 
 
 		 616 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>