177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1199 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  100 
 
 		 187 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  54.6 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  43.65 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  44.38 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  42.16 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  45.14 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  46.81 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  44.06 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  43.8 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  38.95 
 
 		 171 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  40.82 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  33.72 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  33.68 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  40.71 
 
 		 148 aa  102  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  39.01 
 
 		 171 aa  101  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  39.22 
 
 		 162 aa  101  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  38.46 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  40.15 
 
 		 185 aa  99.4  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  33.57 
 
 		 153 aa  97.8  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  41.72 
 
 		 162 aa  96.7  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  39.13 
 
 		 238 aa  96.7  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  37.06 
 
 		 227 aa  95.5  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  36.17 
 
 		 232 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  30.99 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  33.69 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  31.69 
 
 		 175 aa  92  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  41.73 
 
 		 150 aa  92  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  30.99 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  41.18 
 
 		 153 aa  91.3  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  34.12 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  38.1 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  38.78 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  38.16 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  33.73 
 
 		 174 aa  88.2  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  40.43 
 
 		 153 aa  87.8  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  39.86 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  39.86 
 
 		 153 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  32.14 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  33.52 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  33.11 
 
 		 153 aa  80.5  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  35.1 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  31.87 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  25.67 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  44.29 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  31.25 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  36.42 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  36.42 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  32.95 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  35.62 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  34.69 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  32.17 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  30 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  37.41 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  33.13 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  31.39 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  37.5 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  32.62 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  30.21 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  35.44 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  29.5 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  34.53 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  37.86 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  31.64 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  37.18 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  34.42 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  32.88 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  30.46 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  29.12 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  37.96 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  31.47 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  28.96 
 
 		 205 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  29.73 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  33.33 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  32.88 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  27.27 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  29.25 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  28.99 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  29.25 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  31.58 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  33.79 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  34.53 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  34.07 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  30.94 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  31.37 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  29.73 
 
 		 388 aa  58.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  30.22 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  29.5 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  37.5 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  33.1 
 
 		 242 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  26.32 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  28.31 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  33.02 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  33.58 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  33.58 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  26.83 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  33.56 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  33.55 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45339  predicted protein  33.9 
 
 		 334 aa  54.7  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>