More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0010 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0010  sensory box histidine kinase/response regulator  100 
 
 		 727 aa  1493    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.3 
 
 		 715 aa  796    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.99155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.58 
 
 		 715 aa  802    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  62.17 
 
 		 726 aa  912    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  78.23 
 
 		 561 aa  481  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0144  sensory box histidine kinase  35.79 
 
 		 709 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 710 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.283964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0218  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 695 aa  246  9e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3734  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 665 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 665 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  27.1 
 
 		 824 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  53.16 
 
 		 649 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1630  sensory box histidine kinase  35.15 
 
 		 710 aa  171  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00580838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 642 aa  171  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  39.26 
 
 		 642 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1656  sensory box/response regulator  38.49 
 
 		 420 aa  167  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1945  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 690 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000961188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2062  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 697 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1885  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 694 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.05 
 
 		 654 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.57 
 
 		 438 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000169909  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2335  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 694 aa  160  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2565  two component signal transduction response regulator  48.7 
 
 		 703 aa  160  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1917  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  47.85 
 
 		 419 aa  156  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0589316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0493  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.91 
 
 		 431 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.62 
 
 		 765 aa  154  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.274696 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  39.03 
 
 		 637 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 		 670 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1758  PAS sensor diguanylate cyclase/phophodiesterase  46.24 
 
 		 700 aa  151  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250633  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  30.67 
 
 		 751 aa  151  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0476  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.92 
 
 		 431 aa  150  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1114  putative diguanylate phosphodiesterase  55.64 
 
 		 568 aa  150  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.09 
 
 		 773 aa  147  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.09 
 
 		 773 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 		 769 aa  145  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4365  response regulator receiver protein  50 
 
 		 340 aa  144  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.97 
 
 		 1431 aa  143  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 		 962 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 		 1977 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 566 aa  137  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.52 
 
 		 484 aa  137  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 546 aa  137  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 905 aa  137  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.77 
 
 		 947 aa  137  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 906 aa  137  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1825  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.15 
 
 		 879 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5218  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  49.28 
 
 		 580 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0126538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.71 
 
 		 1965 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1144  signal transduction protein  49.25 
 
 		 571 aa  130  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1308  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 894 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.455977  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 641 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 640 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 		 1274 aa  130  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 701 aa  130  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 631 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  44.37 
 
 		 637 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  32.99 
 
 		 576 aa  129  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 639 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 509 aa  128  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 421 aa  128  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 556 aa  128  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 911 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 650 aa  129  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 556 aa  129  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.12815  normal  0.758765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4668  histidine kinase  33.92 
 
 		 376 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158807  normal  0.364184 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1191  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.15 
 
 		 836 aa  127  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.668547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  32 
 
 		 461 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 620 aa  127  7e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 639 aa  127  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 456 aa  126  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  31.29 
 
 		 560 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  31.21 
 
 		 461 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  40.45 
 
 		 484 aa  126  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 827 aa  125  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  31.19 
 
 		 461 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 885 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 718 aa  125  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 		 1064 aa  125  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 639 aa  125  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 695 aa  125  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 2783 aa  124  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0500  histidine kinase  32.32 
 
 		 922 aa  124  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 592 aa  124  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 482 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480808 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  30.79 
 
 		 835 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 587 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0975  putative PAS/PAC sensor protein  29.96 
 
 		 516 aa  122  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  30.74 
 
 		 486 aa  122  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 546 aa  122  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.65 
 
 		 1287 aa  122  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 458 aa  122  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.77 
 
 		 1042 aa  121  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.04 
 
 		 754 aa  121  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.94 
 
 		 827 aa  120  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 726 aa  120  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 581 aa  120  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 396 aa  120  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 725 aa  120  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 613 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>