220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1457 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 276 aa  554  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  40.86 
 
 		 278 aa  216  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  44.8 
 
 		 257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1395  rod shape-determining protein MreC  31.27 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0343017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0193  rod shape-determining protein MreC  34.72 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3831  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 		 280 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277446  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5926  Rod shape-determining protein MreC  28.21 
 
 		 278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  33.58 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0807  rod shape-determining protein MreC  32.93 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  28.41 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  30.59 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1803  rod shape-determining protein MreC  26.76 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  25.64 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  24.03 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  27.51 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0866  rod shape-determining protein MreC  22.7 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1166  rod shape-determining protein MreC  26.28 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  30.59 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  32.04 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  26.96 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  24.88 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  27.78 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  26.59 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  24.88 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  28.84 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  27.72 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  27.43 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  27.57 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  26.13 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  25.6 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  25.8 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  25.8 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  28.5 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  26.12 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  24.44 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  25.81 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  24.07 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  26.54 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  26.18 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  24.46 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  24.48 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  22.3 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 317 aa  62  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  24.74 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  22.22 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  23.59 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  28.12 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1190  rod shape-determining protein MreC  22.02 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.759069  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  24.39 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  22.22 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  24.75 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  24.63 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  24.74 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  27.36 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  26.12 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  26.12 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1686  rod shape-determining protein MreC  29.29 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  26.29 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  22.44 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  25.77 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  21.88 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  22.44 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  27.1 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  25.12 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  24.11 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  24.14 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  22.44 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  22.73 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  24.02 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  21.19 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  27.43 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  25.23 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  24.77 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  24.68 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  24.85 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  21.03 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  23.68 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  27.84 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  22.32 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  23.65 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  24.23 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  22.6 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  20.56 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  23.1 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1609  rod shape-determining protein MreC  19.34 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.72705  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  21.21 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  22.83 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  21.05 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  26.44 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  22.83 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  22.83 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 302 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  19.35 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1282  rod shape-determining protein MreC  22.94 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>