More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0172 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0172  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  684    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000263309  normal  0.0370984 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2014  hypothetical protein  28.05 
 
 
352 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2009  hypothetical protein  28.05 
 
 
352 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2996  hypothetical protein  34.55 
 
 
414 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.229433 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  28.01 
 
 
350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3345  hypothetical protein  34.39 
 
 
432 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  29.3 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  24.86 
 
 
344 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  26.26 
 
 
344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3659  hypothetical protein  31.82 
 
 
390 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0638108 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  29.52 
 
 
359 aa  113  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  28.25 
 
 
368 aa  113  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  28.25 
 
 
368 aa  113  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  29.02 
 
 
368 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  24.86 
 
 
344 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  24.86 
 
 
344 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  24.86 
 
 
344 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1020  hypothetical protein  28.32 
 
 
344 aa  112  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  29.21 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  27.94 
 
 
368 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  29.21 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  26.89 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  26.89 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  28.71 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  26.89 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  27.38 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  26.18 
 
 
345 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1150  hypothetical membrane spanning protein  28.32 
 
 
376 aa  110  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  24.86 
 
 
344 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  26.83 
 
 
404 aa  109  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  27.94 
 
 
358 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  26.65 
 
 
348 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3864  hypothetical protein  25.55 
 
 
356 aa  106  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285096  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  25.22 
 
 
372 aa  106  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5234  hypothetical protein  33.33 
 
 
362 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  27.3 
 
 
369 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  27.3 
 
 
369 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  27.3 
 
 
369 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  26.98 
 
 
369 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  27.22 
 
 
389 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  27.16 
 
 
349 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  25.64 
 
 
406 aa  99.8  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  25.96 
 
 
349 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3065  hypothetical protein  24.43 
 
 
342 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.499692  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  25.96 
 
 
349 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  25.96 
 
 
349 aa  99  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01570  predicted inner membrane protein  30.36 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  25.96 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  25.96 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  30.36 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  25.96 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  30.36 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  30.95 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  30.36 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  25.96 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  22.92 
 
 
359 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  30.36 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  25.96 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  31.41 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  24.44 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  31.41 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  30.36 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  25.64 
 
 
349 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  22.75 
 
 
359 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  27.38 
 
 
339 aa  95.9  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  27.3 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  22.65 
 
 
354 aa  94.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  25.52 
 
 
345 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  33.12 
 
 
349 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  33.12 
 
 
349 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  33.12 
 
 
349 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  23.33 
 
 
336 aa  93.6  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  33.12 
 
 
349 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  33.12 
 
 
349 aa  92.8  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4853  protein of unknown function UPF0118  27.61 
 
 
359 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  21.78 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1228  hypothetical protein  31.21 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1044  protein of unknown function UPF0118  27.11 
 
 
345 aa  90.5  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0793  hypothetical protein  25.87 
 
 
348 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414272  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2437  hypothetical protein  24.92 
 
 
341 aa  90.1  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.705178  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  29.49 
 
 
361 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  23.96 
 
 
390 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4788  hypothetical protein  24.7 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  24.85 
 
 
350 aa  87.8  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  23.95 
 
 
360 aa  87  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0006  membrane protein  25.4 
 
 
362 aa  86.3  7e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  28.65 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_93242  predicted protein  31.11 
 
 
489 aa  85.1  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432514  normal  0.15533 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3908  hypothetical protein  32.89 
 
 
383 aa  84  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3067  hypothetical protein  25.1 
 
 
354 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722131  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  29.97 
 
 
338 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1524  protein of unknown function UPF0118  25.63 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3035  hypothetical protein  23.2 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.124885  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2449  hypothetical protein  29.03 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00490145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  23.5 
 
 
393 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  27.8 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  23.29 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  22.13 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  29.52 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3619  hypothetical protein  30 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0542852  normal  0.0156067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>