More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2948 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  54.26 
 
 		 189 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0375  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0366  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.100088  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0389  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0433  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0370  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4869  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0363  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0376  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  23.39 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  22.34 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  27.18 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  21.65 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 324 aa  62  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  25.55 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  52.63 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  52.63 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  52.63 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  52.63 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  52.63 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  52.63 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  52.63 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2680  transcriptional regulator  50 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3453  transcriptional regulator TetR family  28.57 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  26.02 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  52.63 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2718  transcriptional regulator, TetR family domain protein  50 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.087281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  26.02 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  24.23 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50.88 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50.88 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50.88 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50.88 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50.88 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  21.94 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  22.8 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>