More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1230 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 217 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.58 
 
 		 215 aa  204  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.63 
 
 		 213 aa  191  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 213 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 222 aa  184  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0855  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.082304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  41.9 
 
 		 216 aa  177  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  40.65 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.25 
 
 		 218 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.25 
 
 		 218 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 218 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  45.12 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.96 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  44.6 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2019  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.06 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.69 
 
 		 214 aa  171  9e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  42.52 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 216 aa  168  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  40.74 
 
 		 242 aa  167  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.47 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  37.5 
 
 		 220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1676  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.85 
 
 		 228 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4035  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.05 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3789  response regulator receiver  37.38 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 228 aa  160  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2401  response regulator receiver  37.67 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3790  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.82 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  37.32 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4449  two component LuxR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.683214 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 303 aa  158  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0347  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.76 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0851  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.05 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4860  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.43 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.142587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1668  response regulator receiver  34.76 
 
 		 222 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1985  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.76 
 
 		 222 aa  155  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.35 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  37.38 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3957  two component LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.57 
 
 		 241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3764  response regulator receiver  38.21 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.321181  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.78 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  39.61 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.25 
 
 		 216 aa  154  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4343  response regulator receiver  37.96 
 
 		 236 aa  154  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  39.15 
 
 		 220 aa  154  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4712  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.96 
 
 		 236 aa  154  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3079  two component LuxR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 233 aa  154  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 237 aa  154  9e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>