More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1149 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
678 aa  1378    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2326  putative quinoprotein  47.08 
 
 
525 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.55919  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0849  Pyrrolo-quinoline quinone  44.74 
 
 
528 aa  418  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0969  Pyrrolo-quinoline quinone  42.8 
 
 
541 aa  401  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1201  Pyrrolo-quinoline quinone  41.34 
 
 
545 aa  398  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.817213  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  39.43 
 
 
554 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  35.38 
 
 
576 aa  300  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 
577 aa  297  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5419  Pyrrolo-quinoline quinone  35.28 
 
 
576 aa  289  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  36.83 
 
 
568 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3007  Pyrrolo-quinoline quinone  36.14 
 
 
573 aa  284  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3937  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  35.96 
 
 
580 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.79845 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2797  Pyrrolo-quinoline quinone  33.67 
 
 
557 aa  267  5.999999999999999e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  36.71 
 
 
570 aa  266  8e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  35.15 
 
 
572 aa  262  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  34.59 
 
 
579 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 
561 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0851  Pyrrolo-quinoline quinone  34.19 
 
 
558 aa  256  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.46 
 
 
575 aa  250  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4524  Pyrrolo-quinoline quinone  32.66 
 
 
612 aa  248  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2017  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  32.86 
 
 
592 aa  248  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115973  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3660  putative alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
555 aa  247  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  33.66 
 
 
583 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  33.2 
 
 
573 aa  247  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  33.2 
 
 
573 aa  247  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.2 
 
 
573 aa  246  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2867  Pyrrolo-quinoline quinone  30.8 
 
 
614 aa  246  9e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0638606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
587 aa  246  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  33.46 
 
 
575 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4984  Pyrrolo-quinoline quinone  32.15 
 
 
612 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.257884 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  34.12 
 
 
602 aa  243  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0808  Pyrrolo-quinoline quinone  32.47 
 
 
585 aa  242  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.260733 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0341  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  32.72 
 
 
562 aa  242  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409253  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3639  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.95 
 
 
566 aa  241  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347084  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  33.73 
 
 
580 aa  240  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  33.2 
 
 
587 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  34.12 
 
 
575 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  32.84 
 
 
595 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  33.21 
 
 
595 aa  240  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.86 
 
 
575 aa  240  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5037  Pyrrolo-quinoline quinone  32.43 
 
 
613 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.46 
 
 
575 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.65 
 
 
595 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.53 
 
 
588 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2344  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.26 
 
 
611 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.58 
 
 
597 aa  235  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  30.47 
 
 
708 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.81 
 
 
584 aa  233  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1451  Pyrrolo-quinoline quinone  31.84 
 
 
616 aa  233  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.924401  normal  0.0179554 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  31.17 
 
 
563 aa  232  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.61 
 
 
584 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.2 
 
 
589 aa  232  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0099  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.1 
 
 
605 aa  232  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.850532  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  30.87 
 
 
580 aa  231  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.28 
 
 
587 aa  230  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2994  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.01 
 
 
613 aa  229  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.09 
 
 
587 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  32.86 
 
 
562 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.09 
 
 
587 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  31.17 
 
 
591 aa  228  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3624  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.2 
 
 
579 aa  226  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214303  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4951  Pyrrolo-quinoline quinone  33.58 
 
 
577 aa  226  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97328 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.11 
 
 
602 aa  226  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0700  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30.87 
 
 
613 aa  224  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  31.32 
 
 
705 aa  224  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  30.28 
 
 
718 aa  223  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3387  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.05 
 
 
601 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  29.13 
 
 
709 aa  220  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6351  Pyrrolo-quinoline quinone  30.19 
 
 
604 aa  219  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.346402  normal  0.871662 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  34.05 
 
 
593 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0299  methanol dehydrogenase protein, large subunit, putative  29.62 
 
 
619 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0065801  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  31.97 
 
 
730 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  31.71 
 
 
601 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  31.42 
 
 
712 aa  218  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2673  quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  31.36 
 
 
588 aa  216  8e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0513715  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.53 
 
 
724 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0262  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  32.18 
 
 
737 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0206165  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  28.57 
 
 
718 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0726  Pyrrolo-quinoline quinone  32.61 
 
 
549 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0623502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  30.8 
 
 
726 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1781  Pyrrolo-quinoline quinone  31 
 
 
601 aa  213  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981644  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0476  quinoprotein glucose dehydrogenase  30.09 
 
 
600 aa  213  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  28.9 
 
 
600 aa  213  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0344  Pyrrolo-quinoline quinone  29.54 
 
 
623 aa  212  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.122301  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3943  Pyrrolo-quinoline quinone  30.08 
 
 
601 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237421  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0673  PQQ-dependent enzyme-like protein  30.19 
 
 
569 aa  210  7e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  30.33 
 
 
706 aa  209  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0905  alcohol dehydrogenase  30.78 
 
 
711 aa  208  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.879569  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1587  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  31.76 
 
 
601 aa  209  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0721  Pyrrolo-quinoline quinone  30.5 
 
 
702 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30 
 
 
697 aa  208  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  31.57 
 
 
582 aa  207  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  29.28 
 
 
600 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  29.28 
 
 
600 aa  206  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4972  Pyrrolo-quinoline quinone  29.85 
 
 
608 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.779778  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  30.24 
 
 
738 aa  204  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2674  quinoprotein ethanol dehydrogenase  30.89 
 
 
631 aa  203  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3089  Pyrrolo-quinoline quinone  30.89 
 
 
631 aa  203  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3129  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.7 
 
 
631 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957958  normal  0.28425 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1957  Pyrrolo-quinoline quinone  30.47 
 
 
620 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809644  normal  0.548455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>