More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2821 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2821  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 238 aa  129  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  29.83 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3965  regulatory protein GntR HTH  31.36 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  29.33 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  28.33 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  30.46 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  30.86 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  28.57 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  24.56 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  27.49 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  27.47 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  25.85 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.64 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  26.78 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  27.87 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  28.38 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  31.03 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0774  regulatory protein GntR HTH  42.27 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  28.1 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  28.81 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  27.2 
 
 		 256 aa  72  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  28.18 
 
 		 241 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  28.81 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  27.07 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  26.47 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  28.81 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  28.49 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  41.89 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  30.19 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  31.11 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  27.7 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  24.47 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0666  regulatory protein GntR HTH  27.53 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  25.55 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  33.52 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  27.19 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  33.54 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2626  transcriptional regulator PdhR  26.47 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  33.08 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  33.08 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  33.08 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  37.38 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  27.82 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  33.08 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0660  regulatory protein GntR, HTH  27.17 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.519359  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  32.31 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1232  GntR-like  27.35 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  33.08 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  33.08 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  24.05 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6600  GntR domain-containing protein  27.35 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  normal  0.274665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  33.08 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  25.76 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  26.5 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  32.31 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5046  GntR domain protein  27.41 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  25.76 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  27.06 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  27.2 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  28.9 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  26.32 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1326  GntR domain protein  30.36 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0620  GntR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  28.96 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  33.63 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03465  transcriptional regulator PdhR  26.16 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>