More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1858 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  60.54 
 
 		 818 aa  915    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  60.23 
 
 		 841 aa  923    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  43.63 
 
 		 804 aa  656    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  54.71 
 
 		 802 aa  814    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 803 aa  1617    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  59.2 
 
 		 804 aa  895    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  57.99 
 
 		 804 aa  888    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  44.02 
 
 		 800 aa  621  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  44.04 
 
 		 801 aa  614  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  43.66 
 
 		 804 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  44.98 
 
 		 804 aa  597  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  42.15 
 
 		 801 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  41.43 
 
 		 813 aa  579  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  42.57 
 
 		 806 aa  580  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  39.14 
 
 		 791 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  39.73 
 
 		 807 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  43.38 
 
 		 804 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  41.8 
 
 		 811 aa  571  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  37.97 
 
 		 841 aa  571  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  39.4 
 
 		 839 aa  555  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  39.17 
 
 		 820 aa  551  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  38.94 
 
 		 819 aa  534  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  39.32 
 
 		 816 aa  462  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  35.48 
 
 		 768 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  35.28 
 
 		 768 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  31.31 
 
 		 781 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  31.45 
 
 		 774 aa  400  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  30.67 
 
 		 780 aa  394  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  31.41 
 
 		 793 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  33.54 
 
 		 1189 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  32.33 
 
 		 1180 aa  346  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  33.33 
 
 		 1149 aa  340  9e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  32.07 
 
 		 1196 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  33.03 
 
 		 1150 aa  336  9e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  32.53 
 
 		 1150 aa  336  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  32.91 
 
 		 1150 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  31.92 
 
 		 1254 aa  330  9e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  32.15 
 
 		 1208 aa  328  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  31.21 
 
 		 1191 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  31.21 
 
 		 1191 aa  325  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.17 
 
 		 1132 aa  324  5e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.29 
 
 		 1132 aa  323  6e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  30.72 
 
 		 1223 aa  323  7e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.08 
 
 		 1132 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  32.04 
 
 		 1169 aa  319  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  31.99 
 
 		 1168 aa  319  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  30.14 
 
 		 1169 aa  317  6e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.93 
 
 		 1133 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.93 
 
 		 1132 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.93 
 
 		 1133 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.93 
 
 		 1132 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.93 
 
 		 1132 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  31.57 
 
 		 1178 aa  313  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  29.09 
 
 		 1132 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  29.7 
 
 		 1132 aa  312  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  30.38 
 
 		 1158 aa  311  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  29.95 
 
 		 1183 aa  312  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  28.14 
 
 		 1187 aa  311  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  30.34 
 
 		 1197 aa  311  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  31.42 
 
 		 1278 aa  309  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  28.88 
 
 		 1132 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  30.52 
 
 		 1224 aa  306  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  32.65 
 
 		 1171 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  30.72 
 
 		 1136 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.76 
 
 		 1163 aa  303  6.000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  28.18 
 
 		 1191 aa  302  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  29.74 
 
 		 1214 aa  301  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  27.49 
 
 		 1188 aa  301  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  31.05 
 
 		 1235 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  30.07 
 
 		 1136 aa  301  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  30.71 
 
 		 1236 aa  300  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  27.48 
 
 		 1188 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.93 
 
 		 1208 aa  300  6e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  27.94 
 
 		 1188 aa  300  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  30.99 
 
 		 1171 aa  300  7e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0046  B12-dependent methionine synthase  29.94 
 
 		 1220 aa  298  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.61869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  30.94 
 
 		 1235 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  29.24 
 
 		 1154 aa  298  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  30.86 
 
 		 1234 aa  297  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  30.01 
 
 		 1173 aa  297  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  30.89 
 
 		 1235 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  30.95 
 
 		 1235 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  30.32 
 
 		 1192 aa  296  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  30.74 
 
 		 1234 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  29.81 
 
 		 1154 aa  296  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  29.89 
 
 		 1176 aa  296  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  30.33 
 
 		 1158 aa  296  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  31.75 
 
 		 1151 aa  295  2e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  28.43 
 
 		 1182 aa  295  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  30.28 
 
 		 1236 aa  294  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  30.22 
 
 		 1208 aa  294  5e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  27.74 
 
 		 1182 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  30.45 
 
 		 1232 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.23 
 
 		 1239 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  30.12 
 
 		 1239 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  28.74 
 
 		 1215 aa  290  6e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  31.81 
 
 		 1176 aa  290  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  31.15 
 
 		 1199 aa  290  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  29.57 
 
 		 1178 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  31.82 
 
 		 1182 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>